課程設置分三類：
第壹類課程實行邊教學邊實踐，課堂教學講基本原理、基本方法;實踐教學給出小型實踐題目，循序漸進。
這類課程除常規的計算機專業課程外，還要加入軟件工程，對象和組件技術等;第二類課程主要進行理論方法教學，逐步積累，集中時間進行實踐教學。這類課程有：操作系統、編譯原理、數據庫系統、網絡與網絡工程、軟件成熟度模型(CMM)。
第三類課程是綜合多門課程的知識，與科研項目相結合，以不同的目標或不同的應用作為實踐的大型課程設計，如大型程序設計方法課程設計、大型應用軟件課程設計等。