X Window System （X Window系統）是目前Linux構建GUI最常用的系統，最常見的實現是X.Org。類似的還有Wayland（Wayland）。
在Window System（如上，通常是X）之上，有壹系列的Desktop Environment（桌面環境），比如Gnome，KDE等等，來控制桌面、窗口、菜單、通知等行為，提供壹套較為統壹的操作體驗。
Qt，GTK等是GUI程序的開發庫，他們的應用壹般不僅僅在Linux操作系統上，也並不局限於Gnome、KDE之類的桌面環境，也不限制於C、C等開發語言。
同樣構建於Window System之上，有壹系列的Window Manager（窗口管理器），他們是獨立於Desktop Environment存在的，主要是控制窗口的表現。不過實際使用中壹般是每壹個Desktop Environment都提供壹個官方的Window Manager來統壹風格。
Display Manager跟Window Manager相似，基本是獨立於Desktop Environment存在的，也就是說KDM完全可以搭配Gnome使用。他們主要負責以GUI形式接管用戶登錄過程，並且加載用戶指定的Desktop Environment。