除了圖像功能，它擁有不少有用的計算功能例如解多未知數和高次方程（1－6個未知數和1－6次方程），矩陣計算（最大70x70的矩陣（在Main Memory（主內存）剩余空間足夠大的情況下），及可容納27個矩陣）等。解方程及矩陣計算都可以容許輸入復數，這是以前的CASIO圖形計算器沒有的功能。
它並沒有其他圖形計算器例如CASIO Algebra FX 2 Plus、Texas Instruments TI-89 Titanium以及Texas Instruments nSpire CAS和HP-50G等擁有的CAS（計算機代數系統：Computer Algebra System）。它也沒有CASIO ClassPad擁有的手寫輸入功能以及TI-nSpire CAS中文版擁有的中文輸入輸出和320x240大分辨率屏幕。
它也有壹些第壹代機型沒有的新功能如余數計算，同余數計算，最大公約數及最小公倍數( HCF，LCM )、不等式圖像等。
另外，FX-9860G II支持CASIO fx-ES系列計算器的自然顯示( Natural Display )，包括解方程的答案可以用根式表示無理數。它所采用的代數系統為 Perfect-V.P.A.M(第壹代機型)；Perfect Natural V.P.A.M(第二代機型)。（V.P.A.M：Visually Perfect Algebraic Method；盡管第壹代機型已升級到OS2.**，但仍不具有自然顯示功能，需要修改系統，參見“各型號特色功能”標題下的的最後壹點）