已知的例子: 從蝌蚪到蛙的變態發育
高等哺乳類動物指間蹼的消失
眼睛中玻璃體和晶狀體的細胞死亡，是眼睛對光通透重要的壹步
在人體胚胎發育中，四肢的發育也是壹個很好的例子。胚胎長到第5周時出現扁盤狀的肢體萌芽，手指和腳趾之間的蹼消失，四肢才能順利形成其最終形態。
就是在成熟的個體中，細胞雕亡也是必不可少的:
細胞數目和組織大小的控制
組織的更新（如鼻的嗅表皮)。
免疫系統對喪失功能的或是有潛在危險的細胞進行選擇和清除。
清除壞變的細胞
賦予中樞神經系統可塑性。研究人員嘗試在胚胎期激活小鼠的bcl-2基因。該基因會阻止神經細胞的細胞雕亡過程。出生的小鼠腦部神經元數量因此比正常的小鼠多，容積變大。但在測試中顯得比正常小鼠遲鈍。
對生殖細胞進行選擇 (大約95%的生殖細胞會在其成熟之前通過細胞雕亡被清除)
目前在細胞雕亡與癌癥發生和各種自身免疫疾病之間的關系有著很多研究。人們希望激發癌變細胞的細胞雕亡，以達到消弭癌癥的目的。
細胞雕亡在神經退化性疾病中所扮演的角色(如阿茨哈默氏癡呆, 亨廷頓舞蹈病, 帕金森病, 肌肉萎縮性側面硬化病（ALS病）)，是目前熱門的研究話題，人們在這個領域也進行著很多研究。