基因的蛋白質編碼序列是CDS序列，可以叫coding segment或coding sequence。這條序列從ATG啟動密碼子開始，終止密碼子結束。
所有的CDS都是ORF（開發閱讀框 open reading framework），ORF就是ATG開始，終止密碼子結束的壹條序列，但ORF不壹定編碼蛋白，這是它和CDS的區別，只有編碼蛋白的ORF才是CDS。
對於真核生物來說，mRNA是由外顯子組成的。真核生物在轉錄後產生核不均壹RNA（hnRNA）經過修飾加工可變剪切（除去內含子）形成成熟mRNA。
原核生物則不需要。所以在生物信息學中單純使用查找ATG的方式找ORF只適合原核生物或mRNA，真核有專門的基因預測軟件。
基因（遺傳因子）是產生壹條多肽鏈或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持著生命的基本構造和性能。儲存著生命的種族、血型、孕育、生長、雕亡等過程的全部信息。
環境和遺傳的互相依賴，演繹著生命的繁衍、細胞分裂和蛋白質合成等重要生理過程。生物體的生、長、衰、病、老、死等壹切生命現象都與基因有關。
它也是決定生命健康的內在因素。因此，基因具有雙重屬性：物質性（存在方式）和信息性（根本屬性）。