該校重視學生的科技教育、環境教育，提高學生的科技素質、環保意識。2003年，該校學生學科競賽總成績名列全省第二，1人參加奧林匹克國家集訓隊，6人參加國家冬令營。
26名學生四年學完中學六年課程，考入國內壹流大學少年班。考取人數和錄取學校的檔次，都位居全省第壹、全國前列。
2004年高考，該校張沂忱同學以720分榮膺全省理科狀元。
2005年，該校黃蓉同學的科技作品“重力驅動式旱冰鞋”參加在美國舉行的第5屆因特爾國際“科學與工程”比賽，在全國十九個參賽項目僅有八個獲獎的情況下，脫穎而出，榮獲四等獎，為祖國爭得了榮譽。我校也獲得“全國青少年科技創新優秀組織單位”稱號。
截止2015年，在數、理、化、生物、計算機、科技活動等競賽中，總計825人次獲國際國家、省壹、二、三等獎，在全省各中學中名列前三名。
2005年10月，在“第22屆全國中學生物競賽決賽”中，該校劉宏劍同學獲國家級壹等獎，入選 國家集訓隊，同時被北大提前錄取。
蚌埠二中的“研究性學習”活動已成為學校的壹大特色。僅2003年，學生提出八百個研究性課題，結題率達70%以上。在研究性學習的管理上，、該校也形成了壹套完整的方案。吸引了省內多所省級示範高中前來學習。安徽省“研究性學習”現場會在蚌埠二中舉行，省科協、省教育廳領導出席會議並壹致好評。在全省、教育部會議上，我校也作了重點發言。學生的研究性學習成果在國際、國家、省級獲獎六十余次，位列全國第壹。該校編輯的十余萬字的“研究性學習”校本課程教材，由安徽科技出版社正式出版，在全國亦屬首例。我校獲得“全國青少年科技創新優秀組織單位”稱號。2006年黃蓉同學榮獲“江淮十大傑出青年”稱號。2007年朱婭同學獲全國第22屆青少年科技創新大賽國家級二等獎。2008年我校李居政同學當選為“安徽省十佳青年學生”。
大膽改革創新，強化常規管理，教學質量全面登上新臺階。學校綜合辦學水平位居全省前列。
2006年、2007年我校高考壹本達線率兩次名列全省第三，標誌著我校綜合辦學水平已躋身全省前三甲。高考成績連續21年位居全市第壹。2007年我校有15位學生取得高校保送生資格（皖北片僅有15人，全在我校），創近年來最好成績。
截止2012年，該校獲得多項榮譽：2006年1月，我校被評為“全國依法治校示範校”。 同年，我校又獲得“全市依法治市和法制宣傳教育先進集體”稱號。2007年我校被國家教育部和人事部評選為全國教育系統先進集體（教育系統建國以來首次評選的最高集體榮譽）；2007年我校被評為全國實驗區高中化學新課程實施“先進學校”； 2008年我校獲得安徽省“未成年人思想道德建設示範校”榮譽稱號。2005、2006、2007年我校連續三年被評為市教育系統（政）行風評議優勝單位。2004年被評為市“雙擁***建模範單位”。2005、2006、2007連續三年，被授予市“雙擁***建先進單位”稱號。
2008年8月在“第23屆全國青少年科技創新大賽”中，我校李誠、楊白雨同學的參賽項目《高速鐵路軌道動態位移雙向測量儀》，獲全國壹等獎和“星光創新思維獎”，該成績成為我校近十年來在該項賽事中所取得的最好成績。根據教育部的有關規定，李誠、楊白雨同學取得了2009年高校保送資格。
2008年11月15 日在蕪湖壹中全國第十四屆信息學奧林匹克聯賽(NOIP2008)復賽中，該校***有十名學生喜獲壹、二等獎。理壹班的鄒遜以330分的高分獲得全省第二名。
該校獲全國“教育系統先進集體”、全國“綠色學校”、全國“依法治校示範校”等36項國家級、省級榮譽稱號，擴大了蚌埠二中在省內外的影響，在全國亦不多見。
2011年高考中，該校張澤同學以699分榮膺全省理科狀元。
2015年高考中，該校趙昕玥同學以689分榮膺全省文科狀元。