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Python性能分析指南

原文來源 | Huy Nguyen

譯文來源 | 開源中國

雖然妳所寫的每個Python程序並不總是需要嚴密的性能分析,但是當這樣的問題出現時,如果能知道Python生態系統中的許多種工具,這樣總是可以讓人安心的。

分析壹個程序的性能可以歸結為回答4個基本的問題:

1.它運行的有多塊?

2.那裏是速度的瓶頸?

3.它使用了多少內存?

4.哪裏發生了內存泄漏?

下面,我們將用壹些很酷的工具,深入細節的回答這些問題。

使用time工具粗糙定時

首先,我們可以使用快速然而粗糙的工具:古老的unix工具time,來為我們的代碼檢測運行時間。

上面三個輸入變量的意義在文章 stackoverflow article 中有詳細介紹。簡單的說:

real – 表示實際的程序運行時間

user – 表示程序在用戶態的cpu總時間

sys – 表示在內核態的cpu總時間

通過sys和user時間的求和,妳可以直觀的得到系統上沒有其他程序運行時妳的程序運行所需要的CPU周期。

若sys和user時間之和遠遠少於real時間,那麽妳可以猜測妳的程序的主要性能問題很可能與IO等待相關。

使用計時上下文管理器進行細粒度計時

我們的下壹個技術涉及訪問細粒度計時信息的直接代碼指令。這是壹小段代碼,我發現使用專門的計時測量是非常重要的:

timer.py

為了使用它,妳需要用Python的with關鍵字和Timer上下文管理器包裝想要計時的代碼塊。它將會在妳的代碼塊開始執行的時候啟動計時器,在妳的代碼塊結束的時候停止計時器。

這是壹個使用上述代碼片段的例子:

我經常將這些計時器的輸出記錄到文件中,這樣就可以觀察我的程序的性能如何隨著時間進化。

使用分析器逐行統計時間和執行頻率

Robert Kern有壹個稱作line_profiler的不錯的項目,我經常使用它查看我的腳步中每行代碼多快多頻繁的被執行。

想要使用它,妳需要通過pip安裝該python包:

壹旦安裝完成,妳將會使用壹個稱做“line_profiler”的新模組和壹個“kernprof.py”可執行腳本。

想要使用該工具,首先修改妳的源代碼,在想要測量的函數上裝飾@profile裝飾器。不要擔心,妳不需要導入任何模組。kernprof.py腳本將會在執行的時候將它自動地註入到妳的腳步的運行時。

primes.py

壹旦妳已經設置好了@profile裝飾器,使用kernprof.py執行妳的腳步。

-l選項通知kernprof註入@profile裝飾器到妳的腳步的內建函數,-v選項通知kernprof在腳本執行完畢的時候顯示計時信息。上述腳本的輸出看起來像這樣:

尋找具有高Hits值或高Time值的行。這些就是可以通過優化帶來最大改善的地方。

程序使用了多少內存?

現在我們對計時有了較好的理解,那麽讓我們繼續弄清楚程序使用了多少內存。我們很幸運,Fabian Pedregosa模仿Robert Kern的line_profiler實現了壹個不錯的內存分析器。

首先使用pip安裝:

(這裏建議安裝psutil包,因為它可以大大改善memory_profiler的性能)。

就像line_profiler,memory_profiler也需要在感興趣的函數上面裝飾@profile裝飾器:

想要觀察妳的函數使用了多少內存,像下面這樣執行:

壹旦程序退出,妳將會看到看起來像這樣的輸出:

line_profiler和memory_profiler的IPython快捷方式

memory_profiler和line_profiler有壹個鮮為人知的小竅門,兩者都有在IPython中的快捷命令。妳需要做的就是在IPython會話中輸入以下內容:

在這樣做的時候妳需要訪問魔法命令%lprun和%mprun,它們的行為類似於他們的命令行形式。主要區別是妳不需要使用@profiledecorator來修飾妳要分析的函數。只需要在IPython會話中像先前壹樣直接運行分析:

這樣可以節省妳很多時間和精力,因為妳的源代碼不需要為使用這些分析命令而進行修改。

內存泄漏在哪裏?

cPython解釋器使用引用計數做為記錄內存使用的主要方法。這意味著每個對象包含壹個計數器,當某處對該對象的引用被存儲時計數器增加,當引用被刪除時計數器遞減。當計數器到達零時,cPython解釋器就知道該對象不再被使用,所以刪除對象,釋放占用的內存。

如果程序中不再被使用的對象的引用壹直被占有,那麽就經常發生內存泄漏。

查找這種“內存泄漏”最快的方式是使用Marius Gedminas編寫的objgraph,這是壹個極好的工具。該工具允許妳查看內存中對象的數量,定位含有該對象的引用的所有代碼的位置。

壹開始,首先安裝objgraph:

壹旦妳已經安裝了這個工具,在妳的代碼中插入壹行聲明調用調試器:

最普遍的對象是哪些?

在運行的時候,妳可以通過執行下述指令查看程序中前20個最普遍的對象:

哪些對象已經被添加或刪除?

我們也可以查看兩個時間點之間那些對象已經被添加或刪除:

誰引用著泄漏的對象?

繼續,妳還可以查看哪裏包含給定對象的引用。讓我們以下述簡單的程序做為壹個例子:

想要看看哪裏包含變量x的引用,執行objgraph.show_backref()函數:

該命令的輸出應該是壹副PNG圖像,保存在/tmp/backrefs.png,它看起來是像這樣:

在運行的時候,妳可以通過執行下述指令查看程序中前20個最普遍的對象:最下面有紅字的盒子是我們感興趣的對象。我們可以看到,它被符號x引用了壹次,被列表y引用了三次。如果是x引起了壹個內存泄漏,我們可以使用這個方法,通過跟蹤它的所有引用,來檢查為什麽它沒有自動的被釋放。

回顧壹下,objgraph 使我們可以:

顯示占據python程序內存的頭N個對象

顯示壹段時間以後哪些對象被刪除活增加了

在我們的腳本中顯示某個給定對象的所有引用

努力與精度

在本帖中,我給妳顯示了怎樣用幾個工具來分析python程序的性能。通過這些工具與技術的武裝,妳可以獲得所有需要的信息,來跟蹤壹個python程序中大多數的內存泄漏,以及識別出其速度瓶頸。

對許多其他觀點來說,運行壹次性能分析就意味著在努力目標與事實精度之間做出平衡。如果感到困惑,那麽就實現能適應妳目前需求的最簡單的解決方案。

參考

stack overflow – time explained(堆棧溢出 – 時間解釋)

line_profiler(線性分析器)

memory_profiler(內存分析器)

objgraph(對象圖)

end

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