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四種聚類方法之比較

四種聚類方法之比較

介紹了較為常見的k-means、層次聚類、SOM、FCM等四種聚類算法,闡述了各自的原理和使用步驟,利用國際通用測試數據集IRIS對這些算法進行了驗證和比較。結果顯示對該測試類型數據,FCM和k-means都具有較高的準確度,層次聚類準確度最差,而SOM則耗時最長。

關鍵詞:聚類算法;k-means;層次聚類;SOM;FCM

聚類分析是壹種重要的人類行為,早在孩提時代,壹個人就通過不斷改進下意識中的聚類模式來學會如何區分貓狗、動物植物。目前在許多領域都得到了廣泛的研究和成功的應用,如用於模式識別、數據分析、圖像處理、市場研究、客戶分割、Web文檔分類等[1]。

 聚類就是按照某個特定標準(如距離準則)把壹個數據集分割成不同的類或簇,使得同壹個簇內的數據對象的相似性盡可能大,同時不在同壹個簇中的數據對象的差異性也盡可能地大。即聚類後同壹類的數據盡可能聚集到壹起,不同數據盡量分離。

 聚類技術[2]正在蓬勃發展,對此有貢獻的研究領域包括數據挖掘、統計學、機器學習、空間數據庫技術、生物學以及市場營銷等。各種聚類方法也被不斷提出和改進,而不同的方法適合於不同類型的數據,因此對各種聚類方法、聚類效果的比較成為值得研究的課題。

1 聚類算法的分類

 目前,有大量的聚類算法[3]。而對於具體應用,聚類算法的選擇取決於數據的類型、聚類的目的。如果聚類分析被用作描述或探查的工具,可以對同樣的數據嘗試多種算法,以發現數據可能揭示的結果。

 主要的聚類算法可以劃分為如下幾類:劃分方法、層次方法、基於密度的方法、基於網格的方法以及基於模型的方法[4-6]。

 每壹類中都存在著得到廣泛應用的算法,例如:劃分方法中的k-means[7]聚類算法、層次方法中的凝聚型層次聚類算法[8]、基於模型方法中的神經網絡[9]聚類算法等。

 目前,聚類問題的研究不僅僅局限於上述的硬聚類,即每壹個數據只能被歸為壹類,模糊聚類[10]也是聚類分析中研究較為廣泛的壹個分支。模糊聚類通過隸屬函數來確定每個數據隸屬於各個簇的程度,而不是將壹個數據對象硬性地歸類到某壹簇中。目前已有很多關於模糊聚類的算法被提出,如著名的FCM算法等。

 本文主要對k-means聚類算法、凝聚型層次聚類算法、神經網絡聚類算法之SOM,以及模糊聚類的FCM算法通過通用測試數據集進行聚類效果的比較和分析。

2 四種常用聚類算法研究

2.1 k-means聚類算法

 k-means是劃分方法中較經典的聚類算法之壹。由於該算法的效率高,所以在對大規模數據進行聚類時被廣泛應用。目前,許多算法均圍繞著該算法進行擴展和改進。

 k-means算法以k為參數,把n個對象分成k個簇,使簇內具有較高的相似度,而簇間的相似度較低。k-means算法的處理過程如下:首先,隨機地選擇k個對象,每個對象初始地代表了壹個簇的平均值或中心;對剩余的每個對象,根據其與各簇中心的距離,將它賦給最近的簇;然後重新計算每個簇的平均值。這個過程不斷重復,直到準則函數收斂。通常,采用平方誤差準則,其定義如下:

 

 這裏E是數據庫中所有對象的平方誤差的總和,p是空間中的點,mi是簇Ci的平均值[9]。該目標函數使生成的簇盡可能緊湊獨立,使用的距離度量是歐幾裏得距離,當然也可以用其他距離度量。k-means聚類算法的算法流程如下:

輸入:包含n個對象的數據庫和簇的數目k;

輸出:k個簇,使平方誤差準則最小。

步驟:

(1) 任意選擇k個對象作為初始的簇中心;

(2) repeat;

(3) 根據簇中對象的平均值,將每個對象(重新)賦予最類似的簇;

(4) 更新簇的平均值,即計算每個簇中對象的平均值;

(5) until不再發生變化。

2.2 層次聚類算法

根據層次分解的順序是自底向上的還是自上向下的,層次聚類算法分為凝聚的層次聚類算法和分裂的層次聚類算法。

 凝聚型層次聚類的策略是先將每個對象作為壹個簇,然後合並這些原子簇為越來越大的簇,直到所有對象都在壹個簇中,或者某個終結條件被滿足。絕大多數層次聚類屬於凝聚型層次聚類,它們只是在簇間相似度的定義上有所不同。四種廣泛采用的簇間距離度量方法如下:

這裏給出采用最小距離的凝聚層次聚類算法流程:

 (1) 將每個對象看作壹類,計算兩兩之間的最小距離;

 (2) 將距離最小的兩個類合並成壹個新類;

 (3) 重新計算新類與所有類之間的距離;

 (4) 重復(2)、(3),直到所有類最後合並成壹類。

2.3 SOM聚類算法

 SOM神經網絡[11]是由芬蘭神經網絡專家Kohonen教授提出的,該算法假設在輸入對象中存在壹些拓撲結構或順序,可以實現從輸入空間(n維)到輸出平面(2維)的降維映射,其映射具有拓撲特征保持性質,與實際的大腦處理有很強的理論聯系。

 SOM網絡包含輸入層和輸出層。輸入層對應壹個高維的輸入向量,輸出層由壹系列組織在2維網格上的有序節點構成,輸入節點與輸出節點通過權重向量連接。學習過程中,找到與之距離最短的輸出層單元,即獲勝單元,對其更新。同時,將鄰近區域的權值更新,使輸出節點保持輸入向量的拓撲特征。

 算法流程:

 (1) 網絡初始化,對輸出層每個節點權重賦初值;

 (2) 將輸入樣本中隨機選取輸入向量,找到與輸入向量距離最小的權重向量;

 (3) 定義獲勝單元,在獲勝單元的鄰近區域調整權重使其向輸入向量靠攏;

 (4) 提供新樣本、進行訓練;

 (5) 收縮鄰域半徑、減小學習率、重復,直到小於允許值,輸出聚類結果。

2.4 FCM聚類算法

 1965年美國加州大學柏克萊分校的紮德教授第壹次提出了‘集合’的概念。經過十多年的發展,模糊集合理論漸漸被應用到各個實際應用方面。為克服非此即彼的分類缺點,出現了以模糊集合論為數學基礎的聚類分析。用模糊數學的方法進行聚類分析,就是模糊聚類分析[12]。

FCM算法是壹種以隸屬度來確定每個數據點屬於某個聚類程度的算法。該聚類算法是傳統硬聚類算法的壹種改進。

算法流程:

 (1) 標準化數據矩陣;

 (2) 建立模糊相似矩陣,初始化隸屬矩陣;

 (3) 算法開始叠代,直到目標函數收斂到極小值;

 (4) 根據叠代結果,由最後的隸屬矩陣確定數據所屬的類,顯示最後的聚類結果。

3 四種聚類算法試驗

3.1 試驗數據

 實驗中,選取專門用於測試分類、聚類算法的國際通用的UCI數據庫中的IRIS[13]數據集,IRIS數據集包含150個樣本數據,分別取自三種不同的鶯尾屬植物setosa、versicolor和virginica的花朵樣本,每個數據含有4個屬性,即萼片長度、萼片寬度、花瓣長度,單位為cm。在數據集上執行不同的聚類算法,可以得到不同精度的聚類結果。

3.2 試驗結果說明

 文中基於前面所述各算法原理及算法流程,用matlab進行編程運算,得到表1所示聚類結果。

 如表1所示,對於四種聚類算法,按三方面進行比較:(1)聚錯樣本數:總的聚錯的樣本數,即各類中聚錯的樣本數的和;(2)運行時間:即聚類整個過程所耗費的時間,單位為s;(3)平均準確度:設原數據集有k個類,用ci表示第i類,ni為ci中樣本的個數,mi為聚類正確的個數,則mi/ni為第i類中的精度,則平均精度為:

3.3 試驗結果分析

四種聚類算法中,在運行時間及準確度方面綜合考慮,k-means和FCM相對優於其他。但是,各個算法還是存在固定缺點:k-means聚類算法的初始點選擇不穩定,是隨機選取的,這就引起聚類結果的不穩定,本實驗中雖是經過多次實驗取的平均值,但是具體初始點的選擇方法還需進壹步研究;層次聚類雖然不需要確定分類數,但是壹旦壹個分裂或者合並被執行,就不能修正,聚類質量受限制;FCM對初始聚類中心敏感,需要人為確定聚類數,容易陷入局部最優解;SOM與實際大腦處理有很強的理論聯系。但是處理時間較長,需要進壹步研究使其適應大型數據庫。

聚類分析因其在許多領域的成功應用而展現出誘人的應用前景,除經典聚類算法外,各種新的聚類方法正被不斷被提出。

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