壹、兩者的概述不同：
1、機床坐標系的概述：機床坐標系是以機床原點O為坐標系原點並遵循右手笛卡爾直角坐標系建立的由X、Y、Z軸組成的直角坐標系。
2、工件坐標系的概述：工件坐標系是編程時使用的坐標系，又稱編程坐標系，該坐標系是人為設定的。
二、兩者的作用不同：
1、機床坐標系的作用：?機床坐標系是用來確定工件坐標系的基本坐標系。是機床上固有的坐標系，並設有固定的坐標原點。
2、工件坐標系的作用：建立工件坐標系是數控車床加工前的必不可少的壹步。不同的系統，其方法各不相同。
三、兩者的確定方法不同：
1、機床坐標系的確定方法：確定Z軸；傳遞主要切削力的主軸為Z軸。若沒有主軸，則Z軸垂直於工件裝夾面。若有多個主軸，選擇壹個垂直於工件裝夾面的主軸為Z軸。再確定X軸。
（X軸始終水平，且平行於工件裝夾面）沒有回轉刀具和工件，X軸平行於主要切削方向。（牛頭刨）有回轉工件，X軸是徑向的，且平行於橫滑座。（車、磨）
2、工件坐標系的確定方法：建立工件坐標系采用的是坐標系偏移轉換的原理。它的操作原理是通過刀具對工件右端外圓和端面的試切削，及對所切外圓直徑Φ的測量，將圖示刀具試切後所在位置在工件坐標系中的預設坐標值；
通過機床操作面板手動輸入到數控車床相應的刀具補償單元中，數控系統根據此位置預設的坐標值，經過坐標轉換計算，確定工件坐標系原點的位置，從而將機床坐標系原點O機床偏移到所需的工件坐標系原點，這樣就建立了壹個以O為原點的工件坐標系。
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百度百科-機床坐標系