審計人員在審計銀行存款余額調節表時，除核實“未達賬項”項目的真實性外，還應特別註意調節表中異常的情況。對於銀行存款余額調節表審計，須註意以下兩方面的問題：
（1）應正確理解氽業會計報表中銀行存款的真實余額，並制定恰當的審計策略
從企業所編制的銀行存款余額調節表中可以看出，某銀行賬戶會計期末實際存在3個余額：企業編制銀行日記賬余額、銀行所提供的對賬單余額以及銀行存款余額調節表調整後的余額。在存在未達賬項的情況下，由於缺乏“銀行已收（付），企業尚未收（付）”這類未達賬項記賬時所需的原始單據，會計人員在填寫資產負債表中貨幣資金項目余額時，壹般依據日記賬的余額為準。
按會計準則的有關規定：資產負債表所反映的銀行存款余額，應當包括期末最後壹天所收到的所有存放在銀行賬戶的款項，以及所支出的所有從銀行賬戶中劃出的款項；因此，審計時若存在未達賬項，銀行存款余額應根據余額調節表中調節後的余額來反映，而不是企業日記賬或銀行對賬單的余額。對期末未達賬項，審計時須考慮審計計劃階段所設定的重要性水平與項目性質，采取不同的審計策略；若期末的未達賬項金額較小，對企業財務狀況、經營成果、現金流量影響不大，沒有超過該項目所計劃的重要性水平，則沒有必要對未達賬項進行審計調整：
若期末未達賬項金額超過重要性水平，依據銀行存款日記賬余額來編制會計報表在壹定程度上扭曲了企業的財務狀況、經營成果、現金流量，審計人員則須對“銀行已收（付），企業尚未入賬金額”這類未達賬項進行相應的審計調整，以審計調整後余額為期未銀行存款項目的余額。
（2）對銀行存款余額調節表中的未達賬項進行審計的程序在審計時，針對不同性質的未達賬項，應實施不同的審計程序：
“企業已收（付），銀行尚未入賬的金額”的這類未達賬項屬企業已經入賬，而銀行尚未入賬的情況。壹般來說，由於開戶行獨立於企業，銀行不大可能配合作假，所以這類未達賬項壹般屬企業或銀行會計記錄時的差錯遺漏，以及單據傳遞時差所引起的，極少發生銀行故意不入賬的現象；因此，壹般來說審計人員只需審核企業入賬的原始會計憑證（如支票存根、存款單等）的合法性、真實性，再追查核實以後期間銀行對賬單等銀行單據即可。
“銀行已收（付），而企業尚未入賬金額”的這類未達賬項屬銀行已經入賬，而企業未入賬的情況。這類未達賬項，可能是企業或銀行會計記錄的差錯遺漏或單據傳遞時差所致，也可能是氽業故意的舞弊行為，以達到隱瞞或推遲確認收入、資產，減少或延遲交納稅收，虛增業績或隱瞞費用、負債進行盈余管理的目的。因此，審計人員須重點關註此類未達賬項，檢查期後入賬情況，查驗入賬時的銀行單據及相關的原始憑據，通過對其重要性分析，確定是否調整轉入當期。
4.從銀行日記賬至銀行對賬單，銀行對賬單至銀行日記賬兩條線核查銀行存款發生額入賬情況
在審計實務中，常有這樣的情況，企業的出納或相關人員，利用貨幣資金內部控制中的缺陷，通過銀行存款的收付不入賬等手段，將公款私存或用於購買短期投資產品等謀取私利，通過上述方法可能很難發現其中的問題。因此通過隨機抽查某壹月份銀行日記賬與銀行對賬單的發生額，兩條線同時進行檢查，對大額的未入賬銀行存款情況，需進行追查，可以有效的檢查出銀行存款中的舞弊行為，同時對企業的入賬完整性進行查驗。