汽車ECU改裝最簡單的是采用轉換儲存程序芯片方式，更換不同編程的芯片時，只要把ECU的背板拆開，拔掉原來的芯片再換上新的芯片便完事了，由於壹些舊款的E-ROM芯片僅可寫入程序壹次，因此每次修改程序後都須用刻錄機把程序刻入空白芯片來替換出原來的芯片。近年很多新車的ECU使用了可以多次重復讀寫的Flash-Rom (快閃記憶)芯片，在修改程序時不用更換空白芯片便可直接加載，較E-Rom方便多了。
但不論是哪種形式的芯片，原廠和芯片改裝商設計時都會加入保護設計來防止被譯碼和盜拷，因此在改裝時，芯片改裝經銷商先要把每臺車的數據上傳到芯片改裝商去認證車身號碼、ECU編號、年份/規格。在數據確定後，相關的程序才下傳到經銷商的電腦，技師再用刻錄機把數據寫入空白芯片或經原來用作連接原廠檢測電腦的插口，把ECU內的Flash-Rom芯片程序更新。這種形式的ECU改裝方法不會給予車迷任何的調整空間，但好處是省心省時，十分適合壹些沒有或只是輕度改動過發動機(包括進排氣系統)的原裝車。
需要註意的是，大部分人在談到ECU改裝時都只是盯著硬件上的搭配，好像換上某名牌ECU後車子便會有立竿見影的動力性能提升，這實是改裝上的壹大誤區。ECU只是壹件工具，不同的類別和品牌的差異要看妳實際的需要。歸根究底，改裝ECU的效果要看編程人員的功力和是否有足夠的測試設備(如專業用的空燃比表、測功機等)。試想，如果編程員只抱著筆記本電腦，坐在副駕位置和車主在公路上壹邊“生死時速”，壹邊憑感覺去調校供油量和點火正時，這不但危險而且也不科學，調出來的效果可能比原來還要差(當然在壹般街車的改裝程度上，這種方法也是基本可取的)。而在賽車場上，妳常看到工程師現場用手提電腦調校程序，這是在原有改裝程序上根據天氣、賽道情況的程序細微調整，但不會偏離原改裝程序太多。
事實上改裝ECU的最大成本並不在硬件而是在軟件，要開發壹套完全根據個別改裝車情況量身定做的ECU程序，需要壹名資深編程員連同其他技術人員在測功機上工作壹整天甚至是更長時間。說到底，如果調校技術不過硬，或是專業設備不足，應采用壹些著名品牌的芯片或沿用外掛式附加電腦的隨機程序，這些可能並不是最理想的ECU改裝，但絕對是最保險和最合乎成本效益的方法。