南寧市疾病預防控制中心是在原南寧市衛生防疫站、南寧市結核病防治所和南寧市健康教育所的基礎上，於2002年7月8日正式重新組建的公益性衛生事業單位。
其使命是通過對疾病和傷害的預防控制，創造健康環境，維護社會穩定，促進人民健康；其宗旨是以科研為依托、以人才為根本、以疾病控制為中心。