物流工程專業碩士學位的課程針對物流工程專業碩士培養的特點和企業需求設置。教學內容具有寬廣性和綜合性，反映當代物流工程領域相關學科發展前沿。
攻讀物流工程專業碩士學位的研究生，應獲得的總學分不少於32學分，其中學位課學分至少14學分，專業必修課學分至少18學分。