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求 用R語言 統計乳酸菌的基因組序列中 a t c g,咋寫代碼

有現成的包:matchprobes包 裏面有個函數basecontent(seq)計算4中堿基每種的含量;

自己做的話:

#List是妳的序列

unlist(strsplit(List,""))->sep.letter;#把每個字母都單獨分開

#遍歷所有字母

count_a=0; count_g=0; count_t=0; count_c=0;

for(i in 1:length(sep.letter)){

if(sep.letter[i]=="a"){count_a=count_a+1;}

if(sep.letter[i]=="g"){count_g=count_g+1;}

.........................

}

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