《中國醫療設備》雜誌欄目設置宗旨是強調學術性，註重國際化視野，加大互動性和信息量，適當結合原創性評論。在“投稿須知”中已說明本刊所設欄目，現對各欄目的內容要求細化說明如下
專論
由本學科領域著名專家撰寫某些領域的學科進展，為具有前瞻性、導向性、權威性的專題論述文章。
研究論著
報道生物醫學工程、醫療儀器設備等學科領域中的研究創新成果，提出新發明、新方法、新技術，新理論。是通過實驗研究或實踐總結的研究成果，具有創新性、實用性和科學性的文章。如果是省（市）級以上科研立項課題出的論文更為優先（應註明項目編號）；本單位立題和自選課題也可以，也歡迎本學科或相關學科研究生的學位論文。
醫院數字化
報道計算機軟硬件在醫療現代化建設中的創建、開發、應用、維護、升級等方面的創新和經驗，諸如醫院HIS、RIS、PACS、LIS和數字醫學設備等方面開發技術和應用經驗文章。文章應是自己的實際工作經驗，具有創新和新穎之處，而不是壹般工作敘述或“全面性”的工作總結。
儀器原理與使用
主要報道先進的新壹代的醫療儀器設備的構成原理、工作性能、應用範圍和特點。以及應用某種先進醫療儀器設備應註意的問題和使用經驗等。文章應具有先進性、實用性。
質控與計量
報道各類醫療器材等醫療用品的質量控制和計量的具體檢測技術，以及質控與計量的管理、監測的內容、方法、存在問題與建議。也報道有關因醫療器材質量或功能故障引發的醫療不良事件的統計、調查、分析等文章。介紹或講座及科普等文章。
科學管理
報道醫療衛生部門對醫療儀器設備和耗材的科學管理技術和方法，具體包括購置選型、安裝檢測、在用設備管理、使用效率、應用效果分析和經濟效益分析、報廢制度及報廢處理等方面的管理文章。這方面文章要求具有創新點和實用性、科學性，而不是常規的設備購置方法、使用管理、報廢處理的壹般性的工作總結。
臨床工程
這是工程學理論與技術應用到醫療診斷和治療中的新興學科。如這方面論文符合研究論著要求的就放在研究論著欄。不符合研究論著欄論文要求的文章放在此欄。諸如：本學科領域的儀器設備改裝、醫療技術革新、小發明等等文章。
綜合
該欄目文章系為本學科領域的文章中不適合劃歸本刊其它各欄目的文章，均統壹歸為此欄目。諸如：綜述，醫學工程教育與人才培訓，學科進展，新技術介紹或講座及科普等文章。要求本欄目文章具有科學性、先進性和實用性，闡述觀點明確所給數據和技術方法可靠，均註有出處。
設備維修
這是本刊最早開設的欄目，深受同行們歡迎。主要刊登醫院各種在用醫療儀器設備故障維修方面的文章。這個欄目的文章要求作者是實際從事醫療器械維修的技術人員，文章要對所維修設備的工作原理和結構作壹簡要闡述。對出現故障部分，要從工作原理上作明確闡述和故障分析，找出故障原因後排出故障。即能在技術理論指導下，經過分析和檢測出故障、最後排除故障，再經過歸納、總結、提練而撰寫的文章。
維修經驗
該欄目也是刊登醫院在用醫療儀器設備故障維修方面的文章。對文章內容在工作原理分析方面要求較低，文章主要突出作者實際維修工作經驗。要求文章必須是自己的實際工作，經過總結歸納出的經驗，可以與同行們互相學習和交流。
臨床影像技術
該欄目主要報道各種醫學影像設備的基本構成原理、性能、質量保證、功能開發、臨床應用、新技術介紹、發展導向、更新換代等方面的文章。
臨床診斷與治療
由臨床醫生撰寫的應用醫療儀器設備進行診斷和治療的文章，可以是臨床案例，也可以是綜述進展。
專欄
由專家組織就熱點話題發表分析與評論。
性能評測
對醫療設備進行性能參數的比較，為醫院采購設備提供指南與參考。可以是相同功能、不同品牌設備橫向比較，也可以是某品牌設備縱向比較，還可以是對某種設備的性能詳細介紹。
環球視野
介紹國外臨床醫學工程領域先進的管理理論和實踐經驗、法律法規，或者是國外大型學術會議、展覽的及時報道等。
圓桌論壇
醫學工程師與臨床醫生、醫院管理者、企業之間的就本學科領域熱門話題進行對話探討。
資訊
業內會議、展會、企業活動，分類盤點每月醫療衛生領域重要時事（政策與法規，臨床）
企業之窗
本行業代表性企業的宣傳窗口，例如企業家訪談、企業活動專稿、企業技術和設備的深入報道等。
產品點播
熱門和新型醫療儀器、設備、耗材產品的具體性能的詳細介紹。
讀編往來
編輯與讀者的互動空間，如引發讀者思考的編輯手記， 或者讀者來信解答等。