507-508卡拉OK包房的死角（本堂瑛祐知道柯南身份，打算離開日本，柯南對赤井秀壹已死的舉動奇怪。）
509 紅白黃色與偵探團 F/C（水無憐奈向茱蒂透漏情報，組織派出了壹個厲害的偵探波本。沖矢昴登場，搬進工藤新壹的房子。）
510 柯南VS雙重暗號之謎
511 推理對決！新壹VS沖矢昴（柯南發現沖矢昴的推理能力很強，而且是左撇子，愛喝波本酒。）
521 殺人犯 工藤新壹
522 新壹的真實身份與小蘭的眼淚
523 真正想問的事 （新壹第三次恢復）
542-543魚兒消失的壹角巖（灰原哀再次感到沖矢昴的壓迫感。）
563-564偵探團VS劫匪團（臉上帶著燒傷的傷疤、疑似赤井秀壹的人出現，右眼有著明顯的被火燒傷的傷疤。在最後此人撿起了搶劫犯的手槍，在柯南被搶劫犯劫持的緊張時刻，開槍救了柯南。）
578 召喚危機的紅色前兆
579 黑色與13的暗示
580 逼近的黑之時限
581 搖曳的紅色目標（疑似赤井秀壹的人再度出現，同時，在商場的茱蒂老師收到了“這裏很危險，快逃”的字條，此時沖矢昴也在商場，首次見到了傷疤男，說的話意味深長。傷疤男將在商場發生的案件的推理用別人的手機發給了毛利小五郎。琴酒以及基安蒂等人欲檢驗赤井秀壹是否生還，並以此來證實基爾是否是臥底，卻被柯南巧妙地引開。與此同時昴也在尋找傷疤男，而傷疤男卻在被瞄準時對著瞄準鏡露出詭異的笑容。）
616-621福爾摩斯的默示錄（新壹第四次恢復，並向蘭告白。工藤夫婦知道灰原哀是APTX4869的研發者。）
622-623緊急事態252（阿笠博士被綁架，片尾灰原哀再次對沖矢昴表示強烈懷疑。）
646-647幽靈旅館的推理對決（世良真純登場）
651 柯南VS平次 東西偵探推理對決（茱蒂、卡邁爾在看到世良的照片後表示世良“很像某個人”，而詹姆斯則壹眼看出世良是女孩子。）
656-657博士的視頻網站（世良看到博士視頻中印出來的灰原哀的影子，並向光彥、元太打聽了“博士家的小女孩”（即灰原哀）、鄰居（即沖矢昴）的情況。並對著沖矢昴的窗戶說：“我還以為是誰隨隨便便地住進來了呢，不過現在看起來真是杞人憂天了啊……”最後世良將視頻中意外拍到的灰原影像在電腦中刪除。）
667-668婚禮前夜（安室透登場，成為小五郎弟子。）
671-674 偵探們的夜想曲（沖矢昴脫口而出的壹句“不要露出那種表情”，似乎讓灰原感到相當在意。Vermouth給波本打電話，安室透，沖矢昴，世良真純同時接到電話）
675-676 壹丁點都不原諒(灰原回想起沖矢的那句“不要露出那種表情”，和曾在組織臥底的諸星大（即赤井秀壹）的用語十分相似。世良真純對工藤新壹似乎早有了解，對灰原哀表現出興趣，並關註傷疤秀壹)
681-683 以性命為賭註的戀愛轉播（結尾處安室透為高木的指導警官伊達掃墓，暗示兩人曾是朋友)
684-685 泡沫、蒸汽和香煙（灰原的舉動和二人對話表示，沖矢的頸部隱藏著某個秘密）
690-691 工藤優作未解決的事件（沖矢昴舉止可疑，世良在房間中發現了女性線索，最後世良含淚回望柯南和蘭，說：“果然我是個壞孩子呢。”）
699-700 逼近灰原秘密的黑影（偵探團被困，灰原迫不得已服解藥恢復身體，被光彥拍下視頻，被世良、安室、沖矢看到。）
701-704 漆黑的特快列車（世良真純，安室透身份揭曉。黑衣組織再次出場，目標雪莉。怪盜基德受柯南所托假扮宮野誌保進入最後壹節車廂，車廂脫落後，貝爾摩德引爆炸藥，基德乘滑翔翼逃走。後貝爾摩德發現Sherry沒死但未向組織報告。安室透對赤井之死產生懷疑，準備重新調查。沖矢昴露出與赤井秀壹相同的眼神。）
705 密室中的柯南 （波本繼續以安室透的身份出現）
706 在波本面前解謎（波本發現柯南使用手表型麻醉針，對其產生興趣，並懷疑“沈睡的小五郎”與柯南之間的聯系）