馮子存有著很高的藝術天分,同時他從小受到家鄉民間音樂的熏陶:他的大哥會拉板胡、四胡,當過吹鼓手;二哥會吹笛子。在哥哥們的影響下,馮子存也喜歡上了音樂,他尤其鐘愛笛子,因此從小跟二哥學吹竹笛。
馮派竹笛藝術風格在全國影響頗大,他成為半個世紀以來竹笛的開拓者之壹。他把畢生的精力貢獻給了竹笛事業。馮子存先生為竹笛奉獻壹生的高尚精神和品德久遠影響、激勵著人們。他勤勞壹生,為民族音樂事業的發展做出了突出的貢獻,是中國音樂界的驕傲。
馮子存與人合作改編的《喜相逢》,不僅成為笛界的名曲,還被改編成鋼琴、小提琴、木琴演奏曲目,被世界亞太音理會編入各國音樂教材。出版有《馮子存笛子曲選》。