空我是超古文明留下的戰鬥武器，壹次考古發現令五代雄介成為假面騎士，但亦因此喚醒了它的死敵未確認生命體。帶上超古代腰帶的雄介對抗集團式的未確認生命體。
考古隊發掘出罕見古墓，內藏壹個佩戴石化腰帶的古屍，突現神秘怪人出現將全隊人員殺死。事件後未確認生命體開始出現於民居，正義樂天的青年人五代雄介遇上怪人，雄介受出土石腰帶感召將之戴上，腰帶詭異地融入雄介體內，新壹代假面騎士空我誕生！未確認生命體不斷出現於大城市東京，雄介變身 空我對抗，可惜亦被警方視為當中的未確認生命體般危害人類。
在多次與怪人戰鬥，五代開始領悟到超古代力量的運用， 變化成能力不同的化身：跳躍力極高的藍色青龍形態、超官感的綠色天馬形態及堅硬盔甲的紫色泰坦形態。警探壹條壹向眼見警方無法對抗未確認生命體，他把心壹橫把警方秘密研制的高性能警用電單車試驗品，偷出來交予五代助他對敵。未確認生命體壹直觀察現代人類的生活，竟連駕車也學會了，要對付他們看來愈來愈棘手。這時出土碎片合成的神秘甲蟲飛來協助雄介，更與TRCS電單車滆合壹起戰鬥。
在壹次戰鬥中空我被未確認生命體註入了腐蝕內臟的毒素，雄介中毒的病情不斷惡化，心臟停了，瞳孔也放大，縱使樁秀壹極力搶救也沒用， 正當雄介接近死亡時，超古代力量令雄介死而復生。但雄介再次變成 空我後有壹種仿似電流遊走身內的感覺，於是他拜托櫻子和樁秀研超古代文字的內容，櫻子在解讀的過程中，發現了當中超古代空我的秘密。
另壹方面未確認生命體的力量及知慧越來越高，椿秀壹研究出空我更強的金色力 量，可惜擔心雄介因金色力量會失去自我，變成像古代空我的純戰鬥而生生物兵器！其後龜怪人防護力超強， 空我提升為泰坦形態的利劍亦未能將之刺倒，為免更多無辜者受害，雄介決定冒險使用紅色空我的金色力量，驚天動地的壹腳踢出，不但引發怪人大爆炸，威力之大甚至摧毀附近建築物群，令四周夷為平地。引發地區大爆炸的紅色 空我金色力量驚人，嚇驚全城人類，傳媒亦發表針對空我的言論。本來警方已接受空我的存在，因受壓可能不再支援空我。而經過連番戰鬥的TRCS電單車因金屬疲勞度已無法再使用，而科警研為 空我研制的新車BTCS，又因警方高層怯於輿論壓力而被沒收。對騎電單車行兇的未確認生命體，空我更陷於劣勢之中…。
壹次氣憤的雄介殺敵時，激起他的戰鬥力至新高峰，結果將敵人殺得忘形，這時最強的黑色空我影子出現在雄介眼前。另壹廂櫻子研究遺跡血字時有驚人發現，空我與未確認生命體之首領零號竟是同壹類的。零號開始進行大屠殺，在短暫的時間內已有超過三萬人遇害，縱使 空我出手阻止，在絕無還手之力下，被打至腰帶破裂。雄介為了消滅零號，便要成為可怕的純戰鬥的黑色終極空我。經與各好友道別，跟櫻子許下承諾後，雄介便心如止水的踏上與零號終極決戰之路。