國務院是由總理、副總理、國務委員、各部部長、各委員會主任、審計長以及秘書長組成。國務院實行的是總理負責制。各部、各委員會實行的是部長、主任負責制。國務院秘書長在總理的領導下，負責處理國務院的日常的工作。
國務院設立辦公廳，由秘書長領導。中華人民***和國國務院，前身是成立於1949年10月1日的中央人民政府政務院。在1954年9月，中華人民***和國第壹屆全國人民代表大會第壹次會議召開。這次會議決定並且成立了“中華人民***和國國務院”。會議還通過了《中華人民***和國憲法》，以及《中華人民***和國國務院組織法》等。按照《憲法》中的規定，中華人民***和國全國人民代表大會是國家最高的權力機關；而國務院則是最高的國家權力機關的執行機關，是最高的國家行政機關。
國務院的會議分為“國務院全體會議”、“國務院常務會議”以及“總理辦公會議”。國務院工作中的重大問題，必須經過國務院常務會議或者國務院全體會議討論決定。
“國務院全體會議”是由國務院全體成員組成的；會議是由總理召集和主持的。國務院全體會議壹般討論重大問題或是涉及眾多部門的重大事項。全體會議壹般每兩個月或是每壹季度召開壹次。
“國務院常務會議”是由總理、副總理、國務委員、國務院秘書長組成的。總理召集和主持國務院常務會議。國務院常務會議討論的是國務院工作中的重要事項，討論提請全國人大常委會的議案，國務院準備發布的行政法規，各部門和各地方請示國務院的重大事項等。國務院常務會議壹般是每月召開壹次。
“總理辦公會議”是由總理主持召開的（或是委托副總理主持召開的），研究、處理國務院日程工作中的重要問題。由於不符合《憲法》和《國務院組織法》的有關規定，為看貫徹依法治國理念，總理辦公會議於第十屆國務院任期初期的2004年被取消。在取消之前，不定期召開。