雖然各個版本的大體結構上都遵從了原著，但在結局上仍稍有差異。
1993
馬景濤版的結局：宋青書為防止周芷若與自己的父親宋遠橋互相殘殺而不幸身亡，芷若悔悟，並決心未完成師傅遺願，光大峨眉，與張無忌比試，最後經張三豐點化後去除魔障，出家為尼。朱元璋為篡奪明教教主不惜壹切手段對付張無忌，並先後害死了張無忌的外公和舅舅以及楊逍，還想殺掉趙敏滅口。後被範遙識破，張無忌和趙敏想殺掉朱元璋，最終為了天下蒼生而放棄。張無忌失去民心，辭去了明教教主，攜趙敏歸隱，過著神仙般的生活。
2001
吳啟華版的結局：楊不悔與殷梨亭結合，與楊逍三人齊享天倫之樂。芷若對無忌因愛生恨，由正入邪，因發瘋而失憶，後與宋青書歸隱。張無忌在明教教主與趙敏之間選擇了後者，辭去教主之位，與趙敏浪跡天涯。
2003
蘇有朋版的結局：芷若受到殷離與宋青書的冤魂的譴責，幡然悔悟，重任峨眉掌門。張無忌深感自己過於註重私人感情，不適合幹大業，便將教主之位讓與朱元璋，與趙敏來到冰火島——他的父母曾經生活過的地方——***度余生. 2009
鄧超版的結局：張無忌帶領眾人擊退韃子兵後，依然將教主之位辭去，隨趙敏壹同來到蒙古，卻仍立於趙敏與周芷若之間無法選擇，趙周二女之間的鬥爭仍未結束。
實際上的結局是張無忌還是對趙周二女徘徊不定
原文
趙敏見張無忌寫完給楊逍的書信，手中毛筆尚未放下，神色間頗是不樂，便道：
“無忌哥哥，妳曾答允我做三件事，第壹件是替我借屠龍刀，第二件是當日在濠州不得與周
姊姊成禮，這兩件妳已經做了。還有第三件事呢，妳可不能言而無信。”張無忌吃了壹驚，
道：“妳……妳……妳又有甚麽古靈精怪的事要我做……”趙敏嫣然壹笑，說道：“我的眉
毛太淡，妳給我畫壹畫。這可不違反武林俠義之道罷？”張無忌提起筆來，笑道：“從今而
後，我天天給妳畫眉。”
忽聽得窗外有人格格輕笑，說道：“無忌哥哥，妳可也曾答允了我做壹件事啊。”正是
周芷若的聲音。張無忌凝神寫信，竟不知她何時來到窗外。窗子緩緩推開，周芷若壹張俏臉
似笑非笑的現在燭光之下。張無忌驚道：“妳……妳又要叫我作甚麽了？”周芷若微笑道：
“這時候我還想不到。哪壹日妳要和趙家妹子拜堂成親，只怕我便想到了。”張無忌回頭向
趙敏瞧了壹眼，又回頭向周芷若瞧了壹眼，霎時之間百感交集，也不知是喜是憂，手壹顫，
壹枝筆掉在桌上。