1、理念不同
這壹原因可以參考DC電影《蝙蝠俠大戰超人》，超人雖然拯救了世界，但是在跟外星人打鬥的過程中，卻波及到了不少無辜的百姓，正所謂“神仙打架，百姓遭殃”，這便導致了蝙蝠俠開始仇視超人，從而引發兩者之間的大戰。
2、金剛黑化
“金剛黑化”的可能性也是非常高的，片名是《哥斯拉大戰金剛》，因此很可能哥斯拉照樣是主角，而金剛成了反派。
3、金剛不服哥斯拉
在《哥斯拉2：怪獸之王》的最後，哥斯拉覺醒成紅蓮哥斯拉，秒殺了三頭基多拉之後，哥斯拉成為了名副其實的怪獸之王，幾乎所有的泰坦巨獸都前來跪拜哥斯拉，表示願意臣服哥斯拉。
但是唯獨金剛沒有來，金剛的性格比較高傲，所以不會服氣哥斯拉的地位，因此這也可能引發兩者之間大戰的原因。
劇情簡介：自從魔斯拉、翼龍拉頓、三頭龍基多拉和哥斯拉混戰結束後，帝王組織已經在骷髏島建立了觀察區，大部分資料也向公眾開放；此時的金剛也已經長大。壹家高科技公司APEX利用資料，嘗試壹項大膽的任務，意圖消滅哥斯拉，但這壹任務風險和危機***存。
然而，哥斯拉感應到了APEX的機械巨獸，開始向人類發動攻擊；APEX見狀決定利用金剛探尋地心世界以獲得更多能源。壹心只想回到真正的家園的金剛與他的保護者們踏上了壹次艱難的旅程。與他們壹道前行的還有壹個年輕的孤兒女孩——吉雅。
這個女孩與金剛之間存在著壹種獨特而強大的緊密聯系；但意想不到的是，他們在前行的航道上與憤怒的哥斯拉狹路相逢，深藏在地心深處的奧秘也由此揭開。
以上內容參考：百度百科--哥斯拉大戰金剛