註：在多部劇場版中都出現過的，小編在以下介紹中不再重復講述！
1、《超夢的襲擊》—夢幻、超夢
夢幻像只粉色的小貓，可以用意念飛行，它擁有所有神奇寶貝的基因，幾乎可以學會所有神奇寶貝的技能，因此夢幻被認為是神奇寶貝的始祖，沒有固定的棲息地，壹直在世界各處遊走，但是人類壹般是看不到它的。
超夢是夏伯利用夢幻的細胞進行基因重組而產生的人造小精靈，沒有性別，因為被多次重組改造，超夢生性非常兇暴，完全不相信人類。超夢屬於超能力小精靈，戰鬥力無敵，目前已知有兩種超級進化形態：超夢X、超夢Y，兩種形態分別側重力量和速度。
2、《洛奇亞的爆誕》—洛奇亞、急凍鳥、火焰鳥、閃電鳥
洛奇亞性情溫順，是可以控制天氣的神奇寶貝，統領三大神鳥，輕微煽動翅膀就可以產生強大的破壞力，長久地獨自沈睡在深海中。三大神鳥：急凍鳥，通體藍色，據說翅膀由冰幻化而成，散發著冷氣，所到之處無不下雪；火焰鳥，長有紅色羽毛，頭頂和尾巴都如火焰般燃燒；閃電鳥，橘黃色的尖嘴，羽毛像尖刺壹般，能控制雷電，常被人們敬為雷神。
3、《結晶塔的帝王》—炎帝
炎帝壹點都不陌生了，超強的火炎神奇寶貝，能噴出比火山巖漿威力還強大的火炎，據說炎帝吼叫時，世界上的某處就會有火山噴發。
4、《穿越時空的遭遇》—雪拉比、水君
雪拉比，外貌像是小妖精的神奇寶貝，身體呈樹葉綠色，能夠穿越時空，並給自身到達的地方帶去生機，凡是到過的地方，樹木茂盛，繁花盛開，而且能夠復活死去的同伴，並有凈化的能力。
水君，傳說是北風的化身，有著藍色寶石壹樣的頭飾，周圍是白色如風壹般的飄帶，擁有凈化水源的能力，經常在世界的四處奔波，與鳳王關系最親近。
5、《水都的守護神》—拉帝亞斯&拉帝歐斯
雌性粉紅色的拉帝亞斯和雄性藍色的拉帝歐斯，外形都像小型噴氣機的龍神奇寶貝，能夠進行高速飛行，且飛行中前臂能縮到身體中，平時利用羽毛折射光線，變成透明來隱藏自己，具有極高的智慧。
6、《七夜的許願星》—基拉祈
沈睡壹千年才醒來壹次的神奇寶貝，頭像五角星，背部有兩條仙子壹樣的飄帶，會在聽到純潔的歌聲後醒來，當腹部的“真實之眼”睜開時，可以實現許願者任何的願望。
7、《裂空的訪問者》—代歐奇希斯、烈空坐
代歐奇希斯，長得像外星人的神奇寶貝，來自宇宙，據說是由宇宙中的病毒變異而生的，戰鬥中有四種形態，分別註重不同的能力，代歐奇希斯不喜歡戰鬥，沒有明顯的感情，身體損傷後可以迅速再生。
烈空坐，是壹條綠色的飛龍，因為喜歡臭氧，所以壹直在臭氧層中環球飛行，進食大氣中的水和其他粒子，只在某些特定的地點才降落下來休息。因為是龍屬性，因此可以學會流星群和破壞光線等威力強大的技能。
8、《夢幻與博導的勇者》—夢幻、鋼神柱、冰神柱、巖神柱鋼神柱又名雷吉斯奇魯，鋼系神奇寶貝，身體是由比已知的任何材料都要堅硬的物質構成的，經過了長達幾萬年的巨大地下壓力的磨練，身軀變得刀槍不入；冰神柱又名雷吉艾斯，冰系神奇寶貝，由南極的冰所構成，如水晶壹般，胳膊和腿都呈錐型，在空氣中飄浮移動，身體被零下200度的冷氣包圍，巖漿都無法融化；巖神柱又名雷吉洛克，臂長腿短，沒有大腦和心臟，如果在對戰中損壞了身體，能通過填補巖石來治愈，因此，構成雷吉洛克的巖石來自數個不同的地方，這使得其外形看上去像壹個拼合物。
9、《滄海的王子》—瑪納霏、蓋歐卡
瑪納霏身體的百分之八十都是水，很容易受到周圍環境影響，能夠遊很遠的距離回到自己的出生地，生來就有同任何神奇寶貝心靈相通的能力，可以通過交換意誌與神奇寶貝和人類交換心靈，雖是傳說中的神奇寶貝，但是可以生蛋。
蓋歐卡是壹種大型外表與鯨魚相似的神奇寶貝，擁有控制水元素和帶來降雨的能力，偶爾會用此能力來擴充海洋的面積，平時性情鎮定、平和，但在與宿敵固拉多相遇時，會展開戰鬥，並制造出災難性的天氣。
10、《決戰時空之塔帝牙盧卡VS帕路奇亞VS達克萊伊》—帝牙盧卡、帕路奇亞、達克萊伊
帝牙盧卡存在於壹個不同的維度，居住在夢幻之島上的時限之塔，有著控制時間的能力，被稱作時間之神，它可以扭曲時間來讓時間加快或減慢甚至停止，背上的翼狀結構可以擴張來更好的控制時間之流，是唯壹會時光咆哮技能的神奇寶貝。與帕路奇亞是死敵。
帕路奇亞具有扭曲空間並創造平行空間的能力，居住於另壹個維度，其幾乎不可能被研究，有非常強的領地意識，是已知的唯壹能夠習得技能隔空切斷的神奇寶貝，與帝牙盧卡相遇會發生災難性的戰鬥。
達克萊伊有壹雙黑色的爪狀手，整體外形像沙漏，壹般情況下是沒有腿的飄浮狀態，遇險時能化為影子以躲避敵人的攻擊，偶爾會導致他人無休止的噩夢，除非人的身上攜帶著“新月之羽”，但其實“引發噩夢”不過是壹種防禦行為，而不是故意的惡意行為。
11、《基拉帝納與冰空的花束》—基拉帝納、天空形態謝米
基拉帝納棲息在反轉世界中，具有幽靈屬性和龍屬性的神奇寶貝，擁有兩種形態，能夠穿梭和掌控除時間和空間之外的維度，可以快速地感應並且追蹤自己的目標。處於起源形態時，基拉帝納能夠隨意穿梭這些維度，但由於重力的變化，將變為另類形態，在穿梭時需要自口中放出旋風以創造入口。
謝米能夠能夠分解掉大氣當中的毒素，並使荒蕪的大地變成花海，擁有陸地和天空兩種形態。天空形態的謝米勇敢活潑，吸入汙染的空氣，在自己體內完成凈化並將其分解成水和光，最後以種子閃光的方式排出凈化產物，其爆炸的威力巨大。謝米能夠通過心靈感應進行交流，並能感受他人的感恩之心。
12、《阿爾宙斯超克的時空》—阿爾宙斯、基拉帝納、帕路奇亞、帝牙盧卡
阿爾宙斯是壹只白色，外形似馬的神奇寶貝。據說它創造了整個神奇寶貝世界，也正因為此，阿爾宙斯被認為是所有種族中存在最久的。重新創造“時空神話的神奇寶貝”的這種能力被猜測是用來在神奇寶貝訓練家們捕捉到了其中的任何壹只神奇寶貝時保護這壹維度的，還有恢復被摧毀的事物的能力、讓事物憑空消失和使時間停滯的能力。傳說它壹直在關照並保護神奇寶貝星球，並從流星雨壹類的浩劫中拯救過人類。
13、《幻影的霸者索羅亞克》—雷公，雪拉比、水君、炎帝，（索羅亞克並不是神獸）
雷公外表像龐大的劍齒虎，兩顆鋒利的獠牙。總是伴隨著雷電出現，背部的暗紫色雲朵可以釋放出落雷，可以通過創造雷雲來飛行，性格乖僻，不相信人類，喜歡在各地遊走，經常幫助遇到危險的電系寶貝，所到之處會與雷電屬性的神奇寶貝產生***鳴。
14、《比克提尼與白色英雄雷希拉姆/黑色英雄捷克羅姆》—比克提尼、雷希拉姆、捷克羅姆
比克提尼是只奶油色類似松鼠的神奇寶貝，像兩個翅膀壹樣張開的尾巴，使它有飛行的能力。它的體內可以產生無盡的能量，並可以將這股能量通過觸摸的方式傳遞給其他神奇寶貝或者人類。比克提尼也是唯壹能學會火焰彈的神奇寶貝。
雷希拉姆全身呈白色，頭部酷似壹只白狼，擁有火和龍屬性的神奇寶貝。若投入戰鬥，會進入超頻驅動模式，能力大爆發，尾部呈紅色，並噴出火炎，高速飛行，能使出燃盡壹切的招式。
捷克羅姆全身呈深灰色，似帶翼恐龍的神奇寶貝，擁有電和龍屬性。經常躲藏在雷雲中，可以產生強大的力量來讓尾巴的引擎運轉，同時釋放強力的電氣，進入超頻模式後，他也會創造反重力場讓自己在空中快速飛翔，不被空氣的阻力和地球引力影響。
15、《酋雷姆VS聖劍士凱路迪歐》—酋雷姆、凱路迪歐
酋雷姆是和捷克羅姆、雷希拉姆同時誕生的、最強大的龍系神奇寶貝，能利用翅膀和尾巴儲存極寒的空氣，並釋放出暴風雪和冰雹的招式，使用“基因之楔”後，可以分別與雷希拉姆和捷克羅姆合體，轉化為焰白和暗黑形態。據說它痛恨人類，會把人吃掉。
凱路迪歐是四足像小馬駒的神奇寶貝，擁有水和格鬥屬性。深藍色的蹄子可以噴出水流，以達到打擊對手或淩空躍起以及在水面滑行的效果。在學會“神秘之劍”後的覺醒狀態下，原本的獨角變得又長又粗且變成了深藍色，堅不可摧。
16、《神速的蓋諾賽克特超夢覺醒》—蓋諾賽克特
蓋諾賽克特是壹種兩足遠古的昆蟲機器人神奇寶貝，被電漿軍團從化石中復活，背部的大炮是被電漿團進行改造的結果，在將四肢折疊並縮回頭部後，蓋諾賽克特會變為高速飛行形態。它的專用招式是高科技光炮。
17、《破壞之繭與蒂安希》—蒂安希、哲爾尼亞斯、伊裴爾塔爾
蒂安希是小碎鉆的突變體，頭上有顆粉紅色的圓形鉆石，能夠通過壓縮空氣中的碳元素不斷制造鉆石，用於自身防禦。在傳說中能夠保護自己的旅伴免受災禍和疾病的傷害。超級蒂安希頭上的鉆石變成心形，被稱為“粉紅的皇室公主”，盡管如此，蒂安希實際上是沒有性別之分的。
哲爾尼亞斯是壹只外形似鹿的神奇寶貝，在頭上有八只角向外伸出，角發出七色光芒時能夠分享出永恒的生命。當走到生命盡頭時，它會向身周所有的生物釋放出自己所有的生命力，化身為樹陷入千年沈睡，創造出壹片森林。
伊裴爾塔爾是壹只像巨型鳥的神奇寶貝，身體呈Y型，外表暗黑色，有吸收生物生命的能力，壽命將近的時候會吸收身周所有生物的生命，之後變回壹個繭，長眠千年。與哲爾尼亞斯的能力完全相反。
18、《光輪的超魔神》—胡帕、固拉多（其他太多不詳說，前面都已介紹）
固拉多是神奇寶貝世界陸地的創造者，具有強大的掌控光、熱的能力，並能蒸幹洪水泛濫的地區。固拉多在地底的熔巖中沈睡，壹旦其醒來，火山就會噴發。固拉多在與宿敵蓋歐卡相遇時，會展開殊死搏鬥。固拉多有兩種形態，原始形態和爆發形態。
胡帕也是可以扭曲空間的神奇寶貝，在被封印時，身上只有三個圓環，都可以隨意取下變大變小，並可以將任何物體、人、神奇寶貝傳送到任何地方。解開封印後，身體呈現巨人形態，圓環增加為六個，戰鬥時手臂可以飛出。據說會使用可以扭曲空間的圓環搶奪壹切。原型可能來自於中國的哪咤。
19、《波爾凱尼恩與機巧的瑪機雅娜》—瑪機雅娜
瑪機雅娜是500年前由科學家制造出的人造神奇寶貝，因時間的流轉身體褪色變為灰色，胸中嵌有壹顆“魂心”，球狀，是瑪機雅娜的生命和靈魂所在。瑪機雅娜在睡覺或者傷心時都會變成精靈球的形狀。本身沒有太強的攻擊力，可以從手前段變出花朵。
20、《就決定是妳了！》—鳳王、瑪夏多
鳳王是壹種類似鳳凰和孔雀外形的神奇寶貝，具有復活逝者的神奇力量，傳說在鐘之塔燒毀後，復活了死去的三只不知名的神奇寶貝為炎帝，雷公，水君。在鳳王飛過的地方會形成彩虹，傳說看到鳳王的人能夠獲得永遠的幸福。
瑪夏多是幽靈和格鬥系的神奇寶貝，生性膽小，不喜歡在人面前露臉，可以潛入影子中隱藏自己，戰鬥中也可以潛入對方的影子，復制對方的動作和力量。