1、功能範圍：萬彩動畫大師是壹款國產動畫制作軟件，具有操作簡單的特點，適用於制作微課、動畫廣告、宣傳短片等多種類型的內容。Flash則是壹款動畫制作軟件，雖然操作也不難，但要制作出優秀的動畫作品可能需要較高的美術繪畫功底以及分鏡頭的運用技巧。
2、素材與自定義程度：萬彩動畫大師內置了大量模板和海量素材，用戶可以直接套用或自定義。同時，它還支持導入本地素材，為用戶提供了極大的便利。而Flash在素材提供和自定義程度上與萬彩動畫大師有所不同，但具體差異需要根據實際使用情況進行比較。
3、輸出格式：萬彩動畫大師可以輸出視頻、exe等格式。而Flash的輸出格式可能有所不同，具體情況需要根據軟件的實際功能進行確定。