1、《玄武初現》
多年前壹次失誤，捕頭周沖多名部下喪命玄鐵鏢，周沖也壹蹶不振。最近內閣大臣蔣進之女遭綁架，案發現場竟發現了玄鐵鏢蹤跡，周沖請命重回六扇門，順藤摸瓜打入敵穴，救出蔣進之女，並壹步步接近當年陰謀的真相……
2、《雙面人》
壹宗多年前的殺人案浮出水面，牽出壹個在逃的殺手，六扇門捕快張壹和劉魁聯手偵查，發現案中有種種蹊蹺，就在案情逐漸大白時，劉魁和張壹的身份也浮出水面，劉魁為了張壹犧牲了自己，而張壹則決定和過去訣別……?
3、《致命營救》
張壹奉命執行壹項任務，不想卻中了圈套。周沖帶著祝英前去營救，裏應外合救出張壹，並從倭寇手中救出數名村民，將倭寇頭子竹下壹郎正法，投敵叛國的將軍劉猛受到懲罰。周沖和張壹祝英正式組成“玄武”小組。
4、《忠義烽火》
高麗叛軍突起，大明援其火器並由高麗將軍崔代元押送，不料途中被劫，六扇門玄武小組調查發現是監守自盜蓋因崔之義女被叛軍綁架，陷崔於兩難境地。玄武小組為崔打動，誓在追回火器的同時救出人質，保其忠義兩全！
5、《蒼生客棧》
壹夥神秘匪徒意欲在即將舉行的祭天盛典上行刺皇帝，六扇門必須在此之前將該案破獲。種種線索指向襄陽的蒼生客棧，當玄武小組趕到時，壹夥匪徒竟將整個客棧的客人劫為人質——而他們的目標，卻在所有人的預想之外……
6、《浴火恩仇》
神秘殺手殺死琴館盲女，引出了逃亡在外的唐珂。追查中張壹發現，仍有十枚毒火球流落江湖，並被壹個女殺手計劃用來除掉朝中反對魏忠賢的壹幹忠臣！危急時刻，玄武小組再次出戰，而唐珂也由此將了結唐門的血海深仇。
7、《淪陷》
大金使節達哈蘇出使大明以求兩國平和，六扇門接到使命護衛。卻不料達哈蘇抵達後，其副手俄然發問，裏應外合占據了六扇門，目的是要殺死達哈蘇，挑起兩國戰役。面臨淪亡，同門慘遭屠殺，玄武小組打開拼死的激戰。
8、《假鈔劫》
京城出現天啟通寶的假幣，皇帝大怒，命六扇門徹查此事，玄武小組成員奉命調查此事，順藤摸瓜發現巨賈柳百川與假幣案有千絲萬縷的聯系，隨著調查的深入，他們發現了柳百川的另壹個身份，也由此離真相更近了壹步。
9、《鐵牢》
專門關押監犯的黑山監獄年久失修，欲將監犯搬運，六扇門接到任務幫忙。張壹帶著唐珂前往預備，不料監獄中臨時關押的兩個女犯卻引來了壹批奧秘殺手血洗鐵牢，張壹和唐珂無可奈何聯合獄中監犯壹起抗敵，等待救援……
10、《絕戰》
天啟皇帝駕崩，崇禎即位之時，準備法辦奸臣魏忠賢壹黨，在這關鍵時刻卻發現記載魏罪證的萬言書被盜，六扇門和魏忠賢的黨羽銀鬼同時出發追蹤盜書之人，並展開了關乎正邪交鋒、恩怨情仇甚至社稷安慰的最終“絕戰”！