壹、江寧校區
南京醫科大學的江寧校區***有兩個門：北門和西南門
從北門進入距離體育場、圖書館等地較近，還方便欣賞到櫻花坡。
從西南門進入距離各學院和研究生公寓較近，還方便欣賞到南丁格爾像。
二、五臺校區
南京醫科大學的五臺校區壹***有兩個門，都在西北側。
西北側主要是教學樓所在地
而東南側主要是壹些醫院和醫學院所在地。