傾世皇妃大結局是馥雅殺死度雲。
馥雅壹個人站在城樓上，經歷了這麽多的事情，好像做了壹場夢壹般，死了那麽多的親人，父皇、母後、花爺爺、雲珠還有祈佑，現在她終於可以放下國仇家恨，跟祈佑在壹起了，可是祈佑卻已經不在了。
綠翹鬼鬼祟祟的想逃出皇宮，她怕度雲會殺自己滅口，只因度雲有把柄落在自己的手中，綠翹將所有的事情都告訴了馥雅，馥雅簡直不敢相信自己的弟弟做出這些事情。
馥雅來到度雲的寢宮中，果然在桌子上發現了祈佑的兵書，自己的弟弟為了江山竟然變成了這般心狠手辣。幕布後面傳來連思壹聲聲的“祈佑，祈佑”，馥雅過去壹看，竟然是連思，不禁產生壹絲的憐惜。度雲將連思在馬車上動手腳的事，告訴了馥雅，可是那些都是已經過去的事情了。
馥雅壹個人在河邊搖著撥浪鼓，痛哭起來。第二天，度雲準備登基的時候卻不見眾大臣來上朝，是馥雅讓大臣們晚些再來，她想親自給弟弟戴上皇冠。
在戴皇冠的時候，馥雅將皇冠上的簪子插進度雲的脖子之中，在度雲的壹聲聲哀求中，馥雅走出了大殿，度雲死在大殿之上。馥雅離開深宮，來到相思湖畔，去打找祈佑，只因她答應祈佑會陪他在這相思湖畔到老。