1、性質不同
PCI-E是接口；NVME是協議。
2、傳輸速率不同
NVME：nvmessd的傳輸速率比pci-essd的傳輸速率更大。
PCI-E：pci-essd的傳輸速率比ssd：nvmessd的傳輸速率更小。 ?
3、功耗控制不同
NVME：nvmessd為非易失性存儲器標準，功耗控制比pci-essd的功耗控制更少。
PCI-E：pci-essd為易失性存儲器標準，的功耗控制比ssd：nvmessd的功耗控制更多。
4、特點不同
PCI-E：抗幹擾性強，傳輸通道專有性點對點串行連接；傳輸速率快，支持雙向傳輸模式，還可以運行全雙工模式；支持熱拔插以及熱交換特性；兼容性好不僅可用於南橋和其他設備的連接，也可以延伸到芯片組間的連接，甚至也可以用於連接圖形芯片。
NVME：NVMe也大大的提升了SSD的IOPS性能，在制定AHCI規範時並行性的想法並沒有完全融合到規範內，利用NCQ功能可以對傳輸能力進行優化，但是接口並不允許SSD真正最大限度地發揮其應有的並行性。
NVMe標準的解決了不同PCIe SSD之間的驅動適用性問題，此前的PCIe SSD，均需要安裝驅動程序後才能正常使用，而不同的廠商又各自為政，每個廠商產品都有自己的驅動，SSD也不能作為引導使用。但支持NVMe標準之後，PCIe SSD就可適用於多個不同平臺，也不需要廠商獨立提供驅動支持。