夏亞官方確認死亡，阿姆羅官方沒有明確說死亡，作品中的設定地球聯邦認定失蹤，時限到後認定死亡，牛高達在大氣層中燒毀，現在壹般也是認為死亡了，可以說同歸於盡。
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在大家都已絕望而放棄努力的時候，驚人的奇跡發生了，夏亞與阿姆羅精神***鳴以及所有善良的人們的精神力，化作了巨大的能量場，像壹道光環圍繞著地球，地面上所有的人都觀賞到了這壹奇景，那是比極光更加美麗的人類的心靈之光，而且，在這光的作用下，阿克西斯緩緩脫離了地球的軌道，向著宇宙的深處漂去，可阿姆羅和夏亞就此失蹤……
依照官網說法是在阿克西斯戰役時，夏亞和阿姆羅在“阿克西斯的虹光”中與牛高達同化，實際上就是同歸於盡。
擴展資料：
劇情簡介——
第壹次新吉恩戰爭（哈曼反亂）結束後，宇宙世紀0089下半年間，聯邦對太空殖民地加強了經濟等方面的制裁，但此類措施的實行，亦只會引起宇宙移民對立情緒急劇上漲、各路反聯邦勢力紛紛崛起而已。
宇宙世紀0090年2月，聯邦為收容難民建起殖民衛星——“甘泉”；
但此時在無人知曉的情況下，於哈曼死後重掌新吉恩指揮權壹度銷聲匿跡的夏亞?阿茲納布已秘密潛入並藏身其中。
3月，聯邦軍為維持軍事上的威懾力，建立外圍獨立精銳部隊郎德?貝爾，由實戰經驗老道的布萊德?諾亞上校擔任指揮官，隊中更有以“壹年戰爭”時期著名的王牌MS駕駛員阿姆羅?雷上尉為核心的眾多精英作為成員。
宇宙世紀0092年12月，夏亞?阿茲納布在接受電視采訪時發表了向地球聯邦政府的宣戰布告，第二次新吉恩戰爭（亦稱阿克西斯戰爭或夏亞之亂）由此正式爆發。