石器由於版權原因和代理商更叠頻繁，運營商和版權歸屬非常混亂，在日本主要由DIGIPARK代理，在中國大陸可以分為四個時期：JSS和華義國際***同代理時期（1.0-2.0），華義國際單獨代理（2.0-7.5），金山代理新石器時代（8.0），以及復活後的勝思新代理石器（8.5和2.5***存），臺灣地區主要有JSS與華義國際，華義國際自行研發，陶朱科技復活新代理三個時期。
1.0-原始石器時代
最高等級上限:120
無家族系統
無騎乘寵物系統
中途增加交易系統
中途增加包月系統
中途由1分鐘0.10點數變成為1分鐘0.12點數(包月300點變成為360點)
2.0-家族開拓史
最高等級上限:140
增加AI(自動戰鬥)系統
增加加美航空公司，可往返飛行於各島之間。
增加家族系統
增加騎寵系統
增加精靈王的傳說—轉生系統
2.5-精靈王傳說
增加寵物轉生系統
開放新地圖—天空之島
增加攻擊性魔法
新增任務
3.0-伊甸新大陸
新增五大城市(地城,水城, 火城,風城, 伊甸)
開放寵物新技能
4.0-新9大家族
新增五大莊園
增加了10種新騎寵
新增可愛的表情
全新的魔族任務
增加新技能
增加新素材、裝備
5.0-寵物進化史
新增寵物融合系統
6.0-海賊王遺跡
新增海底地圖——淚之海
新增道具:魚鰓草, 海底呼吸用
新增海底任務
新增海底寵物
7.0-石頭就業所
新增職業系統: 白狼勇士, 追獵者, 闇靈法師
新增密語系統
新增裝備系統: 手套, 左手, 鞋子, 腰包
新增英雄戰場(壹***132樓, 可獲得流星手套: 攻+25防+50敏+20)
7.5-精靈的召喚
新增職業技能
寵物二轉
人物六轉
新地圖
8.0-失落的世界（臺灣）（大陸名稱為：新石器時代） 大陸金山軟件代理運營的石器時代，自8.0之後的版本與之前的版本區別開來，重新定名為新石器時代。
新增寵物裝備系統
新增導師系統
新增任務日誌
新增冰城地圖——瑞爾亞斯
新增冰城寵物
新增回爐系統
新增簽到系統
新增海底寵物融合系統(類似5.0)
8.5-魔域大冒險（臺灣）
大陸地區的石器時代並未更新到8.5即告停服，而臺灣石器則堅持到8.5開放。
新增全新冒險地圖魔域
壹個神秘的地域，沒人知道魔域所存在的地方，借由魔界之門通往充滿火山煙霧與毫無生氣的世界，新增大小十幾張地圖等妳前往冒險。
新增新增全新系統
魔軍討伐獎勵系統：
玩家可以借由擊殺魔界將領取得身上物品才可換取討伐積分，同樣的該積分因陣營的不同，而可以換取不同的獎勵。
每日常駐活動系統：
借由提供魔域前線勇士物資而提供每日任務讓玩家參與，可以獲得許多道具。
日常任務及榮譽值商城：
多項有趣好玩的日常任務供玩家參與；通過完成日常任務可以獲得榮譽值，榮譽值可用於在榮譽值商城中購買各種強力道具和寵物。
復活後的石器時代
在臺灣由陶朱科技代理，大幅改變8.5版本內容，而大陸則隨著勝思網絡的代理更新至8.5，與2.5版本並存但遊戲內容枯燥乏味。商城虛擬道具價格極其昂貴。
遊戲介紹
V8.5“魔域大冒險”故事背景延續V.7.5“精靈的召喚”而來。傳說中艾巴登的部下－－雷爾，妄想利用精靈的力量占據人類世界，最終被勇者發現了背後的陰謀，被擊敗後逃離了人類世界，從此下落不明。但是在不久後，卻從伊甸大陸遙遠的邊境傳來艾巴登率領魔軍準備來襲的消息，為此，族長們發出了號召，募集所有勇者前往抵禦強大的敵人。