在遊戲主界面點擊挑戰-秘境探索即可進入探索玩法（80級開啟）。需要從起點開始，點擊六邊形格進行探索，每次點擊探索需要消耗1點行動點，行動點類似於只能在秘境使用的體力值，隨時間回復，也可用元寶購買，行動點上限=玩家等級。所能點擊的格子必須和已開啟的格子相鄰。秘境中會隨機探索出特殊格，包含事件，寶箱，小偷，守軍，巢穴等多種可能性。
寶箱格會打開寶箱，獲得忠魂強化石、忠魂箱子等道具：
事件格會隨機出現武魂、戰魂、培養丹、寶物精煉石、命魂等基礎培養素材中的三個，可在這三種素材中自由選擇壹種。
巢穴格會進入巢穴戰鬥，勝利後獲得金幣、忠魂強化石、忠魂精華等道具。
小偷格會進入與小偷的戰鬥，小偷是限時的，開啟1小時後若未消滅將會逃走，勝利後可以獲得升遷令等官道具。
蜀國守軍吳國精英等格會進入戰鬥，勝利後獲得各國的賞賜道具和忠魂精華，所獲得的賞賜道具種類和守軍所屬國家壹致，賞賜道具對同陣營的英雄將會帶來雙倍效果。
副本都會有戰力值作為參考，可以視情況決定是否挑戰，同戰力下精英格會比守軍武將資質更高，更難應付。
在特殊格中戰鬥勝利或領取獎勵都會消耗行動點獲得探索值，所獲得的探索值等於在該特殊格消耗的行動點，探索值充滿後可點擊挑戰BOSS，戰勝BOSS可進入下壹層，隨著層數增加獎勵會更豐厚。進入下壹層後，不可返回之前的樓層，秘境***300層。越高層掉落的獎勵越好，探索值滿了且戰力比較富余的情況下，可以選擇前往下壹層。如果覺得後續可能較為吃力，將某層探索結束後可以選擇重置所在樓層。根據vip等級每天的重置機會將增多，重置後該層回到始狀態。
秘境存在難度等級，難度等級根據玩家歷史最高戰力計算，難度等級越高其中守軍戰力越強，獎勵倍數越高。難度等級每周計算壹次，每周第壹次進入秘境時計算玩家本周難度等級。最高10級，可獲得5.5倍獎勵。
每周會大結算壹次，根據玩家本周所通過的樓層數量及達到的最高層決定，結算結果在玩家周壹第壹次進入秘境時顯示。到達最高層後，挑戰BOSS會重置最高層，不占用玩家重置次數。