自來也死亡是在：第353話，自來也豪傑物語，自來也不敵佩恩六道，不幸戰死。
劇情：
自來也雖然想出了壹個對付培因的方法，卻也因此犧牲了左手，而培因的數量也增加為六名，其中壹人過去曾是自來也的徒弟之壹彌彥，然而彌彥同樣也擁有輪回眼這件事讓自來也感到困惑。最終，自來也戰死。
擴展資料自來也戰敗經過：
後末自來也得知“曉”首領佩恩及成員小南的真正身份，原來是自己第二次忍界大戰末期在雨忍村所收的徒弟。
從前大蛤蟆仙人亦曾對自來也預言他會收壹個獨當壹面的孩子為徒，而這孩子會為忍界未來帶來空前的和平或毀滅，總會壹天他就被迫要作出“選擇”他的選擇會將世界引向和平或者毀滅。
初時自來也以為眼前的佩恩，就是預言中的變革者，作出“選擇”的時刻也已經到了。故壹場師徒之戰壹觸即發。
自來也使出仙人模式，召來兩位蛤蟆仙人（深作及誌麻大人）相助，成功打敗了三個佩恩，結果由於大意以及不了解佩恩六道的相關情報，所以不幸被打敗而犧牲。
但臨死前自己查出了佩恩六道及其本體的秘密（都是自己曾經遇到的忍者，六道均為屍體傀儡，受長門操控）。
參考資料：