神秘海域故事模式和持續速破模式的區別為：獎杯方式不同、任務不同、讀檔不同。
壹、獎杯方式不同
1、故事模式：故事模式得到獎杯的方式是通過完成設定好的故事任務。
2、持續速破模式：持續速破模式得到獎杯的方式是在速破規定時間範圍內完成任務。
二、任務不同
1、故事模式：故事模式有專門設定好的主線和支線任務，玩家根據不同的遊戲選擇進行任務。
2、持續速破模式：持續速破模式只有不同的場景的競速比賽任務，沒有復雜多樣的支線任務。
三、讀檔不同
1、故事模式：在故事模式中，只要在退出模式前存檔，就可以在下壹次進入時對保存的記錄進行讀檔。
2、持續速破模式：在持續速破模式中，沒有存檔讀檔功能，每壹次退出後下壹次進入，將重新開始。