1、第壹部：《神奇寶貝無印篇》
《神奇寶貝無印篇》系列動畫《神奇寶貝》第壹部，因為沒有副標題，為了方便稱呼並與後續作品如“超世代”區分，而有“無印”這個代稱（即“沒有副標題”的意思）。其藍本是第壹、二世代遊戲《口袋妖怪紅》等。
《寶可夢》（Pocket Monsters）***分為關都地區石英聯盟、橘子群島橘子聯盟、城都地區城都聯盟三篇，其中城都聯盟還包括了壹小段漩渦列島大賽的故事。在橘子群島時，小剛留在內木研究所，換小建和小智、小霞壹同旅行，直到城都聯盟，才又由小剛回鍋。
2、第二部：《精靈寶可夢：超世代》
《精靈寶可夢：超世代》（ポケットモンスター
アドバンスジェネレーション）是系列動畫《精靈寶可夢》的第二部，由日本動畫公司OLM制作。從2002年11月21日到2006年9月14日在東京電視臺播出。是精靈寶可夢：無印篇的續集，***有192集。
***分為豐緣地區豐緣聯盟及關都地區對戰開拓區兩篇，和前面的劇情不壹樣的就是，故事變成了兩個主線，小智為了參加豐緣聯盟，努力挑戰道館，豐緣聯盟結束後，則改挑戰故鄉關都地區新設的對戰開拓區，而小遙則以成為協調訓練家努力，挑戰各地的華麗大賽，取得緞帶勛章，好參加大型慶典，兩人都為了達成各自的目標，與寶可夢壹同奮鬥。
3、第三部：《精靈寶可夢：鉆石與珍珠》
《精靈寶可夢：鉆石與珍珠》（ポケットモンスター
ダイヤモンド&パール）是由日本動畫公司OLM制作的動畫作品，系列動畫《精靈寶可夢》的第三部。於2006年9月28日到2010年9月9日在日本東京電視臺播放，全191話。是《精靈寶可夢：超世代》的續作，簡稱DP。
其藍本是第四世代遊戲《精靈寶可夢鉆石·珍珠》，也是第壹部直接采用對應遊戲名稱的原創動畫。受到小茂鼓勵的小智，帶著皮卡丘和長尾怪手來到了神奧地區，與新認識的小光和重新加入的小剛開始了新的冒險。
4、第四部：《精靈寶可夢 超級願望》
《精靈寶可夢 超級願望》（ポケットモンスター
ベストウイッシュ）是由日本動畫公司OLM制作的動畫作品，於2010年9月23日至2013年10月3日在日本東京電視臺播放，全142話。是《精靈寶可夢：鉆石與珍珠》的續作，簡稱BW。
在結束了神奧地區的旅程後，小智與媽媽和大木博士壹同乘飛機前往合眾地區。在那裏，小智結識了帶著牙牙的少女艾莉絲，及寶可夢酒侍兼道館館主天桐，三人於是壹同展開在合眾地區的旅程。
5、第五部：《精靈寶可夢XY》
《精靈寶可夢XY》（ポケットモンスター
XY）是精靈寶可夢系列動畫的第五部，其藍本是第六世代遊戲《口袋妖怪XY》作品在日本東京電視臺於2013年10月17日開始放送。是《精靈寶可夢：超級願望》的續作。
告別了艾莉絲與天桐，這次小智在“Da！”章結識的記者三色堇帶領下，前往卡洛斯地區，在那裏他邂逅了天才發明少年，同時也是道館館主的希特隆、以及他的妹妹柚麗嘉、和小時候曾有壹面之緣的少女莎莉娜，並與他們壹同展開在卡洛斯地區的冒險。
6、第六部：《精靈寶可夢太陽&月亮》
《精靈寶可夢 太陽與月亮》簡稱日月，以以往不同的軟Q畫風呈現人物，內容為主角小智留在家中的寶可夢魔墻人偶在抽獎活動抽中大獎，壹家人而前往阿羅拉地區度假。
後來小智就讀寶可夢學校，並暫居庫庫伊博士家裏，在此認識了洛托姆圖鑒和許多就讀寶可夢學校的夥伴，ex:卡奇、水蓮……等。並和他們壹起加入究極防衛隊，讓究極異獸回到原本的世界。在阿羅拉地區得知地區型態與z純晶/手環，而主角小智也獲得壹只卡璞?鳴鳴給的z手環。