國外的壹個武裝犯罪集團攜帶毒氣彈闖入中國領海， 紅細胞次再出征。而唐心怡曾潛伏在此犯罪集團臥底，與其老大認識，以談判員的身份到輪船上偵查。紅細胞上船除何晨光和宋凱飛以外都被麻醉，失去戰鬥力。後唐心怡和何晨光去取毒氣彈，因毒氣彈泄露，唐心怡成植物人，何晨光痛不欲生，欲退伍。
察猜受到蠍子上司北極熊的威脅，被拉下水為寇，在蠍子的幫助下殺了北極熊報仇，走投無路的他只好和王亞東蠍子壹起投奔虎鯊做了海盜。虎鯊集團劫持了夢之舟號遊輪做為人質勒索大批贖金，範天雷的前妻和李二牛的未婚妻也在人質之列，紅細胞和海陸空特種部隊展開了營救工作。
最終，人質被悉數營救成功，範天雷為救自己的前妻被垂死的蠍子打死。何晨光擊斃了蠍子為父報仇，王亞東也死於誤殺，察猜倒在亂槍之中，海盜頭子虎鯊被緝拿歸案。這壹場勝利背負了太多了悲傷，紅細胞因此更加成熟，迎接他們的是更加嚴峻的未來。