1、題材不同：日版白色巨塔的內容還涉及醫療過失的鑒定的法律訴訟，關照面廣，題材比較人文關懷，而臺版內容比較單純，只是不同個性的醫生勾心鬥角的人性刻畫。
2、原作不同：日版原作者是醫學外行的女作家，用大量的調查采訪，努力去描寫出學界、醫療和法律領域的細節，而臺版的作者本身就是個醫生，要寫醫界的故事本比較簡單。