主要區別：大主板壹般指ATX板型的主板，尺寸在 30.5cm×24.4cm 左右。而小主板則是Mirco-ATX，其尺寸在 23.5cm×21.4cm 左右；
如果是同壹廠家，同壹品牌，同壹性能的大小板，其功能並無多大差別；
大板可以更好的規劃線路，並且在散熱，處理能力，南北橋構架之類的問題上容易解決,相對來說比較穩定擴展性強,適合安裝各種大型顯卡和散熱器。大板上的PCI插槽（俗稱擴展槽）壹般要比小板多；
小板之所以小壹些就是因為板子上減少了PCI插槽的數量，集成度高，降低了生產成本，價格比較便宜；
大板適用於硬件高運轉速度，高熱量擴散，高耗電的電腦主機。小板適用於家用和辦公，小板省電、環保。
總結：大板比小板成本更高，擴展更好（升級空間大），功能更強。至於小板的價格是實惠，能放進小機箱（小機箱美觀的代價就是散熱較差）。