TV版：1996年：
001 雲霄飛車殺人事件
002 董事長千金綁架事件
003 偶像密室殺人事件
004 大都會暗號地圖事件
005 新幹線大爆破事件
006 情人節殺人事件
007 每月壹件禮物威脅事件
008 美術館殺人事件
009 天下壹夜祭殺人事件
010 足球選手恐嚇事件
[011 鋼琴月光奏鳴曲殺人事件 1小時特別篇]
012 步美綁架事件
013 奇怪的尋親殺人事件
014 迷樣的訊息阻擊事件
015 消失的屍體殺人事件
016 古董收藏家殺人事件
017 百貨公司挾持事件
018 六月新娘殺人事件
019 電梯殺人事件
020 鬼屋殺人事件
021 電視劇外景隊殺人事件
022 豪華客輪連續殺人事件(前編)
023 豪華客輪連續殺人事件(後編)
024 喪失記憶的美女事件
025 真假人質綁票案
026 愛犬約翰殺人事件
027 小五郎同學會殺人事件(前編)
028 小五郎同學會殺人事件(後編)
029 電腦殺人事件
030 不在場證明殺人事件
031 電視臺殺人事件
032 咖啡店殺人事件
033 偵探團生還事件
034 山莊繃帶怪人殺人事件(前編)
035 山莊繃帶怪人殺人事件(後編)
036 周壹晚上7：30殺人事件
037 仙人掌花殺人事件
038 紅鬼村火祭殺人事件
039 企業家千金殺人事件(前編)
040 企業家千金殺人事件(後編)
041 優勝錦旗被割事件
042 卡拉OK廳殺人事件
1997年：
043 江戶川柯南誘拐事件
044 崛田三兄弟殺人事件
045 敷面膜殺人事件
046 雪山山莊殺人事件
047 體育俱樂部殺人事件
048 外交官殺人事件(前編)
049 外交官殺人事件(後編)
050 圖書館殺人事件
051 高爾夫練習場殺人事件
[052 霧天狗傳說殺人事件 1小時特別篇]
053 迷樣的兇器殺人事件
054 電玩公司殺人事件
055 列車圈套殺人事件
056 清潔公司殺人事件
057 福爾摩斯迷殺人事件(前編)
058 福爾摩斯迷殺人事件(後編)
059 首次跑腿殺人事件
060 插畫畫家殺人事件
061 幽靈船殺人事件(前編)
062 幽靈船殺人事件(後編)
063 大怪獸哥美拉殺人事件
064 第三個指紋殺人事件
065 螃蟹與鯨魚綁架事件
066 夜路殺人事件
067 舞臺女演員殺人事件
068 暗夜公爵殺人事件(事件編)
069 暗夜公爵殺人事件(疑惑編)
070 暗夜公爵殺人事件(解決編)
071 米花之狼殺人事件
072 三胞胎別墅殺人事件
073 少年偵探隊遇難事件
074 死神陣內殺人事件
075 金融公司社長殺人事件
[076 柯南對怪盜基德 1小時特別篇]
077 名門連續慘死事件(前編)
078 名門連續慘死事件(後編)
079 銀行強盜殺人事件
080 放浪畫家殺人事件
081 當紅藝人綁架事件(前編)
082 當紅藝人綁架事件(後編)
083 綜合醫院殺人事件
084 滑雪別墅殺人事件(前編)
085 滑雪別墅殺人事件(後編)
1998年：
086 誘拐現場特定事件
087 白鶴報恩殺人事件
088 德修拉別墅殺人事件(前編)
089 德修拉別墅殺人事件(後編)
090 花香殺人事件
091 搶匪住院事件
092 恐怖爬山殺人事件(前編)
093 恐怖爬山殺人事件(後編)
094 雪女傳說殺人事件
095 小五郎約會殺人事件
[096 走投無路的名偵探 連續兩大殺人事件 2小時特別篇]
097 離別美酒殺人事件
098 名陶藝家殺人事件(前編)
099 名陶藝家殺人事件(後編)
100 初戀情人回憶事件(前編)
101 初戀情人回憶事件(後編)
102 古裝演員殺人事件(前編)
103 古裝演員殺人事件(後編)
104 盜賊集團別墅事件(前編)
105 盜賊集團別墅事件(後編)
106 新聞照片殺人事件
107 鼴鼠星人之謎事件(前編)
108 鼴鼠星人之謎事件(後編)
109 偵探團大追蹤事件
110 料理教室殺人事件(前編)
111 料理教室殺人事件(後編)
112 帝丹小學7大離奇事件
113 白色海灘殺人事件
114 潛水殺人事件(前編)
115 潛水殺人事件(後編)
116 推理小說家失蹤事件(前編)
117 推理小說家失蹤事件(後編)
[118 浪花連續殺人事件 1小時特別篇]
119 假面超人殺人事件
120 蜂蜜雞尾酒殺人事件
121 浴室密室事件(前編)
122 浴室密室事件(後編)
123 天氣預報小姐綁架事件
124 神秘狙擊者殺人事件(前編)
125 神秘狙擊者殺人事件(後編)
126 旅行劇團殺人事件(前編)
127 旅行劇團殺人事件(後編)
128 黑衣組織10億元搶劫事件
1999年：
[129 來自黑衣組織的女子 大學教授殺人事件 2小時特別篇]
130 競技場無差別脅迫事件(前編)
131 競技場無差別脅迫事件(後編)
132 魔術愛好者殺人事件(事件編)
133 魔術愛好者殺人事件(疑惑編)
134 魔術愛好者殺人事件(解決編)
135 消失的兇器搜索事件
136 青色古堡探索事件(前編)
137 青色古堡探索事件(後編)
138 最後上映的殺人事件(前編)
139 最後上映的殺人事件(後編)
140 SOS！步美傳達的訊息
141 結婚前夜的密室事件(前編)
142 結婚前夜的密室事件(後編)
143 疑惑的天體觀測
144 上野出發北鬥星3號(前編)
145 上野出發北鬥星3號(後編)
146 本廳的刑事戀愛物語(前編)
147 本廳的刑事戀愛物語(後編)
148 路面電車急剎車事件
149 遊樂園蹦極事件
150 汽車爆炸事件的真相(前編)
151 汽車爆炸事件的真相(後編)
152 神秘老人失蹤事件
153 園子的夏日海灘冒險物語(前編)
154 園子的夏日海灘冒險物語(後編)
155 水中的鑰匙密室事件
156 本廳的刑事戀愛物語2(前篇)
157 本廳的刑事戀愛物語2(後篇)
158 沈默的環狀線
159 怪奇五重塔傳說(前編)
160 怪奇五重塔傳說(後編)
161 流水亭流出的殺意
[162 飛天密室 工藤新壹最初的事件 1小時特別篇]
163 月亮與星星與太陽的秘密(前編)
164 月亮與星星與太陽的秘密(後編)
165 少年偵探團消失事件
166 鳥取蜘蛛屋的怪物(事件編)
167 鳥取蜘蛛屋的怪物(疑惑編)
168 鳥取蜘蛛屋的怪物(解決編)
169 維納斯之吻
170 黑暗中的死角(前編)
171 黑暗中的死角(後編)
172 復活的死亡訊息(前編)
173 復活的死亡訊息(後編)
2000年：
[174 20年的殺意，新佛尼號連續殺人事件 2小時特別篇]
175 慘遭四次殺害的男人
176 與黑暗組織的再會(灰原編)
177 與黑暗組織的再會(柯南編)
178 與黑暗組織的再會(解決編)
179 咖啡店貨車闖入事件
180 紅色殺意的夜想曲(前編)
181 紅色殺意的夜想曲(後編)
182 九門大搜索
183 危險的處方箋
[184 詛咒的假面在冷笑 1小時特別篇]
185 名偵探遇害記(前編)
186 名偵探遇害記(後編)
187 回響在黑暗中的神秘槍聲
188 危命的復活 洞窟中的偵探團
189 危命的復活 負傷的名偵探
190 危命的復活 第三種選擇
191 危命的復活 黑衣騎士
192 危命的復活 新壹回來了
193 危命的復活 約定的場所
194 意味深長的八音盒(前編)
195 意味深長的八音盒(後編)
196 看不見的兇器 小蘭的初步推理
197 超級汽車殺人事件(前編)
198 超級汽車殺人事件(後編)
199 嫌疑犯毛利小五郎(前編)
200 嫌疑犯毛利小五郎(後編)
201 第十位乘客(前編)
202 第十位乘客(後編)
203 黑天使的翅膀(前編)
204 黑天使的翅膀(後編)
205 本廳的刑事戀愛物語3(前編)
206 本廳的刑事戀愛物語3(後編)
207 太過順利的推理
[208 通往迷宮的入口 巨大神像的憤怒 1小時特別篇]
209 龍神山汽車墜落事件
210 五彩傳說的水中豪宅(前編)
211 五彩傳說的水中豪宅(後編)
212 蘑菇、山熊和偵探團(前編)
213 蘑菇、山熊和偵探團(後編)
214 懷古飯店的神秘事件
215 海灣的復仇(前編)
216 海灣的復仇(後編)
217 被封印的目暮的秘密(前編)
218 被封印的目暮的秘密(後編)
2001年：
[219 名偵探的聚會 工藤新壹vs怪盜基德 1個半小時特別篇]
220 滿口謊言的委托人(前編)
221 滿口謊言的委托人(後編)
222 人魚失蹤記(事件編)
223 人魚失蹤記(疑惑編)
224 人魚失蹤記(解決編)
225 生意興隆的秘密
226 戰鬥遊戲的陷阱(前編)
227 戰鬥遊戲的陷阱(後編)
228 暗藏殺機的陶藝教室(前編)
229 暗藏殺機的陶藝教室(後編)
230 迷壹樣的乘客(前編)
231 迷壹樣的乘客(後編)
232 公寓墜落事件
233 無法消失的證據(前編)
234 無法消失的證據(後編)
235 酒窖密室事件
236 南紀白濱神秘之旅(前編)
237 南紀白濱神秘之旅(後編)
238 大阪的3個K事件(前編)
239 大阪的3個K事件(後編)
240 新幹線護送事件(前編)
241 新幹線護送事件(後編)
242 元太的災難
243 毛利小五郎的冒充者(前編)
244 毛利小五郎的冒充者(後編)
245 向日葵館的槍聲
246 陷入網中的謎團(前篇)
247 陷入網中的謎團(後篇)
248 痊愈之森林的不在場證明
249 偶像們的秘密(前編)
250 偶像們的秘密(後編)
251 OK牧場的悲劇
252 圖畫中的綁架犯
253 本廳的刑事戀愛物語4(前編)
254 本廳的刑事戀愛物語4(後編)
255 松江玉造連句十四次勝負(前編)
256 松江玉造連句十四次勝負(後編)
257 世間奇妙的天罰
258 來自芝加哥的男人(前編)
259 來自芝加哥的男人(後編)
260 搖晃的西餐廳
261 雪夜的恐怖傳說(前編)
262 雪夜的恐怖傳說(後編)
2002年：
[263 大阪雙重神秘 浪花劍士和太閣之城 2小時特別篇]
264 法庭的對決 妃vs小五郎(前編)
265 法庭的對決 妃vs小五郎(後編)
266 情人節的真相(事件編)
267 情人節的真相(推理編)
268 情人節的真相(解決編)
269 犯罪的紀念品(前編)
270 犯罪的紀念品(後編)
271 急忙掩飾的忽略(前編)
272 急忙掩飾的忽略(後編)
273 提問婆婆失蹤事件
274 幽靈屋的真相(前編)
275 幽靈屋的真相(後編)
276 警察手冊丟失事件
277 英語教師VS西部名偵探(前編)
278 英語教師VS西部名偵探(後編)
279 迷宮的陰暗(前編)
280 迷宮的陰暗(後編)
281 年幼的目擊者
282 水流石庭的玄機(前編)
283 水流石庭的玄機(後編)
284 中華街雨中的似曾相識(前編)
285 中華街雨中的似曾相識(後編)
286 工藤新壹NY事件(事件編)
287 工藤新壹NY事件(推理編)
288 工藤新壹NY事件(解決編)
289 迷茫森林中的光彥(前編)
290 迷茫森林中的光彥(後編)
291 孤島的公主與龍宮城(事件編)
292 孤島的公主與龍宮城(追求編)
293 孤島的公主與龍宮城(解決編)
294 愛與決心的粉碎(前編)
295 愛與決心的粉碎(後編)
296 屋形船 震驚的釣魚
297 法庭的對決2 妃vs九條(前編)
298 法庭的對決2 妃vs九條(後編)
299 友情與殺意的關門海峽(前編)
300 友情與殺意的關門海峽(後編)
301 惡意與聖者的行進(前編)
302 惡意與聖者的行進(後編)
303 回來的受害者
2003年：
[304 震動的警視廳 1200萬人質 2小時特別篇]
305 看不見的嫌疑犯(前編)
306 看不見的嫌疑犯(後編)
307 沒有聲音的證詞(前篇)
308 沒有聲音的證詞(後編)
309 與黑衣組織接觸(交涉編)
310 與黑衣組織接觸(追擊編)
311 與黑衣組織接觸(決死編)
312 染上夕陽的布偶(前篇)
313 染上夕陽的布偶(後編)
314 欄桿壞掉的展望臺
315 陽光普照的地方
316 沾汙的假面英雄(前篇)
317 沾汙的假面英雄(後編)
318 幸運的雪茄盒(前篇)
319 幸運的雪茄盒(後編)
320 不在場證明的忍術
321 消失的綁架逃逸車(前篇)
322 消失的綁架逃逸車(後編)
323 服部平次壹籌莫展!(前篇)
324 服部平次壹籌莫展!(後編)
325 火焰中的赤兔馬(事件編)
326 火焰中的赤兔馬(捜査編)
327 火焰中的赤兔馬(解決編)
328 生日葡萄酒之迷
329 金錢買不到的友情(前篇)
330 金錢買不到的友情(後編)
331 疑惑的辣咖喱(前篇)
332 疑惑的辣咖喱(後編)
333 相似的女王陛下(前篇)
334 相似的女王陛下(後篇)
335 東都顯影所的秘密(前篇)
336 東都顯影所的秘密(後編)
337 墜落事件的隱情
338 4臺保時捷(前篇)
339 4臺保時捷(後編)
340 隱藏在廁所裏的秘密(前篇)
341 隱藏在廁所裏的秘密(後編)
[342 豪斯登堡的新娘 1小時特別篇]
343 便利店的陷阱(前編)
344 便利店的陷阱(後編)
2004年：
[345 與黑衣組織直面對決滿月之夜的二元推理 2個半小時特別篇]
346 尋找屁股上的印記(前篇)
347 尋找屁股上的印記(後編)
348 愛與幽靈與地球遺產(前篇)
349 愛與幽靈與地球遺產(後編)
350 被遺忘的手機 (前編)
351 被遺忘的手機 (後編)
352 釣魚大會的悲劇(前篇)
353 釣魚大會的悲劇(後編)
354 小小的委托人 (前篇)
355 小小的委托人 (後編)
[356 怪盜基德之驚異的空中步行 1小時特別篇]
357 戀人是春天的幻影
358 本廳的刑事戀愛物語5(前篇)
359 本廳的刑事戀愛物語5(後篇)
360 不可思議之春天的獨角仙
361 帝丹高中學校怪談(前篇)
362 帝丹高中學校怪談(後篇)
363 都市的烏鴉
364 ***時性事件(前篇)
365 ***時性事件(後篇)
366 眾目睽睽下的碼頭慘劇(前篇)
367 眾目睽睽下的碼頭慘劇(後篇)
368 魔女棲息的糖果之家
369 令人懷疑的男人
370 失而復得的遊戲
371 沈默的航線(前編)
372 沈默的航線(後編)
373 劇毒蜘蛛的圈套
374 星星和香煙的暗號(前篇)
375 星星和香煙的暗號(後篇)
376 限時15時
377 解開桃太郎之迷(前篇)
378 解開桃太郎之迷(後篇)
379 深山溫泉、雪中之夜和年輕女子事件(前篇)
380 深山溫泉、雪中之夜和年輕女子事件(後篇)
381 誰的推理秀(前篇)
382 誰的推理秀(後篇)
[383 甲子園的奇跡!絕不能輸給看不見的惡魔 2小時特別篇]
2005年：
384 目標是毛利小五郎
384 斯特拉蒂瓦裏的不諧和音(序曲)
385 斯特拉蒂瓦裏的不諧和音(插曲)
386 斯特拉蒂瓦裏的不諧和音(尾曲)
387 醉在薩摩的小五郎(前篇)
389 醉在薩摩的小五郎(後篇)
390 本廳的刑事戀愛物語6(前編)
391 本廳的刑事戀愛物語6(後編)
392 謎樣的身長相差20厘米
393 似乎是綁架的事件
394 怪屋大冒險(封印篇)
395 怪屋大冒險(操縱篇)
396 怪屋大冒險(解決篇)
397 辛辣苦口卻又甘甜的湯
398 奇妙壹家的委托(前篇)
399 奇妙壹家的委托(後篇)
400 心存疑惑的蘭
401 寶石搶匪現行犯(前篇)
402 寶石搶匪現行犯(後篇)
403 不可思議的天使之館(前篇)
404 不可思議的天使之館(後篇)
405 呼叫救護車的男子
406 柯南和平次的推理魔術(裝置篇)
407 柯南和平次的推理魔術(公館篇)
408 柯南和平次的推理魔術(解決篇)
409 同時進行的舞臺與綁架(前篇)
410 同時進行的舞臺與綁架(後篇)
411 神社鳥居之驚悚暗號(前篇)
412 神社鳥居之驚悚暗號(後篇)
413 成功率壹半完全犯罪之謎
414 追尋青鳥的偵探團
415 出沒於大兇日的惡靈(事件篇)
416 出沒於大兇日的惡靈(疑惑篇)
417 出沒於大兇日的惡靈(解決篇)
418 米花町閣樓之家
419 八岐大蛇之劍(前篇)
420 八岐大蛇之劍(後篇)
421 銀杏色的初戀(前篇)
422 銀杏色的初戀(後篇)
423 偵探團與青蟲4兄弟
424 來自小醜的照片郵件
2006年：
[425 黑色沖擊!黑衣組織伸出魔爪的瞬間 2個半小時特別篇]
426 給蘭的情書
427 充滿神秘的上學之路(前篇)
428 充滿神秘的上學之路(後篇)
429 無法歸來的二人(前篇)
430 無法歸來的二人(後篇)
431 本廳的刑事戀愛物語7(前篇)
432 本廳的刑事戀愛物語7(後篇)
433 柯南 奇怪的孩子
434 名犬酷兒的功勞
435 以偵探團為焦點的專訪(前篇)
436 以偵探團為焦點的專訪(後篇)
437 上戶彩與新壹 4年前的約定
438 魚郵件的追蹤
439 然後誰也不在就好了
440 極限飛車表演
441 臨終的啊
442 被鋼筋阻擊的男人
443 嘆氣拾潮（前篇）
444 嘆氣拾潮（後篇）
445 俄羅斯藍貓的秘密
446 被封印的歐式窗（前篇）
447 被封印的歐式窗（後篇）
448 目黑的秋刀魚事件
[449 本廳的刑事戀愛物語 偽裝的婚禮 1小時特別篇]
450 圈套VS魔術（前篇）
451 圈套VS魔術（後篇）
[452 金比羅座的怪人 1小時特別篇]劇場版
1：記時引爆摩天樓
2：第十四個的目標
3：世紀末的魔術師
4：瞳孔中的暗殺者
5：通往天國的倒計時
6：貝克街的亡靈
7：迷宮的十字路口
8：銀翅膀的魔術師
9：水平線上的陰謀
10: 偵探們的陣魂歌
OVA
1：柯南 vs Kid vs Yaiba 寶刀爭奪大作戰!
2：16個嫌疑犯
3：柯南、平次與消失的少年
4：基德與水晶之母
5：目標是小五郎!!少年偵探團的秘密調查。
6：追蹤消失的鉆石！柯南&平次vsKID！
TV特別版
特別篇01-鋼琴奏鳴曲"月光"殺人事件
特別篇02-霧天狗傳說殺人事件
特別篇03-柯南對怪盜基德
特別篇04-走頭無路的名偵探！連續兩大殺人事件
特別篇05-浪花連續殺人事件
特別篇06-來自黑暗組織的女子！大學教授殺人事件
特別篇07-飛行中的密室！工藤新壹首次事件
特別篇08-第二十年的殺機！聖佛尼號連續殺人事件
特別篇09-詛咒假面的冷笑
特別篇10-朝向迷宮的入口！巨神像之怒
特別篇11-名偵探的會集！新壹vs怪盜KID
特別篇12-大阪雙謎！浪花劍士與太閣之城
特別篇13-震動的警視廳！1200萬人質
特別篇14-豪斯登堡的新娘
特別篇15-直面黑色組織的對決!滿月之夜的二元神秘事件
特別篇16-怪盜基德的驚異的空中步行
特別篇17-甲子園的奇跡 絕不能輸給看不見的惡魔
特別篇18-Black impact ! 被組織的魔掌觸碰的瞬間
特輯
1：仿徨的紅蝴蝶
2：飛上天空的十顆行星
3：少年偵探團7分鐘特輯
4：追尋迷壹樣的水星怪獸
5：青山剛昌短篇集
6：銀翼的時間之旅
7：水平線上的柯南小五郎