大樓占地面積為5722平方米，建築面積為32680平方米。由8層樓和5層輔樓組成，主樓高度約120英尺（合36.2米），鐘樓高度約140英尺（合43米），大樓總高度約260英尺（合79.2米），是20世紀20年代上海外灘最高的建築物。外墻用金山石砌就，頂部的鐘樓為整幢建築的的縱軸線，兩邊門窗及雕刻圖案對稱、和諧。東立面大門由4根粗壯的多立克柱子支撐，顯得莊重有力。
正門入口有4根希臘多立克式柱，形成門廊
入口大廳藻井以彩色馬賽克相拼的帆影海事圖案為飾，甚為精美。建築上部具有裝飾藝術拍建築特色。鐘樓旗桿位置北緯31度14’20.38”，東經121度29’0.02”，為上海地理位置的標誌點，同時也外灘建築中上最氣派最大者。
上海海關大樓最著名的是它高聳的鐘樓和大鐘。海關大樓安裝大鐘起步於19世紀下半葉，1893年竣工的教堂式江海北關大樓上安裝了壹座海關大鐘。鐘樓依次分為鐘墜、鐘面、主機、鳴鐘幾部分，是壹組調音諧和的鳴鐘裝置。這座大鐘是亞洲第壹大鐘，也是世界著名大鐘之壹。