納米服升級需要先解鎖所有模塊，解鎖模塊需要28點數，初始會給3點，其余25點需要在流程中收集齊。解鎖並裝備模塊，完成相應條件，就能對模塊進行升級。
中文界面有顯示bug(目前1.01，不知道以後是否修復)，納米服模塊的升級條件和進度不會顯示，切換到英文或者日文可以顯示。
模塊在選中狀態下時，完成模塊對應的升級條件就可以升級，升滿級的模塊會顯示★。如果在下個檢查點前死了，當前累積的數據會被清空，刷數據記得到下個檢查點存檔後再退出，當前數據可以隨時按觸摸板查看。
模塊名稱module name升級條件升級說明超級隱匿Super Stealth隱身狀態在敵人身旁待夠100秒感應器升級Sensor Upgrade標記25個目標蠻力Brute Force威力踢擊擊殺15名敵人，空中擊殺15名敵人威力踢擊可以選壹個方便的地方刷，最早可以在第三章壹開始就能踢個大箱子下去，下面壹堆敵人，低難度下來來回回反復踢箱子就行。耐力Endurance跑步3000米，遊泳1000米遊泳可以到第三章水庫裏面暢遊。彈開子彈Deflection吸收15000傷害吸收傷害類的都可以到第三章的水壩那裏刷，靠直升機對著自己噴，直升機傷害效率比敵兵和自動機槍高太多了。威脅偵測器Threat Detector標記20個目標能量升級Energy Upgrade回復5000能量反射加速Reflex Boost瞄準敵人後壹秒內對其進行擊殺延長隱匿模式時間Extend Cloak隱身狀態在敵人身旁待夠100秒急救箱First Aid在瀕死邊緣存活10次，回復25000體力和吸收傷害壹起到第三關靠直升機刷，提示生命危急了就躲進屋裏。超級力量Super Strength抓住25名敵人，威力近戰擊殺25人直接靠近右搖桿打死就算。武器控制Weapon Handling擊殺50人裝備此模塊的情況下殺夠50人，沒其他條件。重型裝甲Heavy Armor吸收150000傷害暗殺者Assassin隱匿擊殺25人靠近時顯示R3隱匿擊殺的才算，不然算近戰打死。輕型裝甲Light Armor吸收100000傷害垂直度Vertically完成30次威力跳躍和30次邊緣攀爬長按跳躍和抓住場景邊緣。