《湄公河大案》的結局是莫雄最終被判處死刑，蒙洪因為跳崖造成重傷在醫院醫治，石橋被劉衛東打死，劉衛東在企圖逃跑的時候被抓獲，AE先生在美國沒擊斃，江海峰完成了中央的任務以後乘坐飛機離開雲南。
莫雄剛開始不承認自己所犯下的罪名，江海峰講述10·5大案的過程，江海峰在看到莫雄臉色越難看，最終莫雄處在崩潰邊緣。
高野進入審訊室後繼續壹點壹點的擊垮莫雄，最終莫雄歇斯底裏的承認了自己的罪行並且在開庭的時候被法官判處了死刑，立即執行。
擴展資料：
《湄公河行動》取材於2011年10月發生的湄公河慘案，13名中國船員慘遭毒手。之後，為了還遇難同胞清白與公道，中國決定派出緝毒精英，組成特別行動小組，潛入金三角揪出幕後黑手的故事。
金三角向為多事之地，多國交界的區域性火藥桶。影片取材於真實事件，講述的是勇猛之師的正義行動。特別行動組跨出國門，於異域揚我國威。
電影中對於當日慘案發生的血腥現場片段式還原，將兇徒的殘忍與滅絕人性展現得淋漓盡致。將專案小組抽絲剝繭、雷厲風行的行動歷程展現得驚心動魄。其激戰及抓捕的過程環環相扣、步步推進，情節緊湊，不拖沓，不雜亂。
百度百科-湄公河大案