RNA提取原理用Trizol的溶液提取，將總RNA與DNA和蛋白質分離。Trizol是壹種酸性溶液，含有硫氰酸胍(GITC)、苯酚和氯仿。GITC不可逆地使蛋白質和RNase變性。隨後進行離心。在酸性條件下，總RNA保留在上層水相中，而大部分DNA和蛋白質保留在中間相或下層有機相中。然後通過用異丙醇沈澱回收總RNA。RNase酶可以通過加入吡咯碳酸二乙酯(DEPC)來滅活。
RNA提取時，加氯仿後分三層：水相(含rna,可能還有少量DNA），中間白色薄層（應該是蛋白和DNA），下層有機相（氯仿和蛋白等）
氯仿是分子量比較大的有機溶劑，在提取RNA時，氯仿可以有效的使有機相和無機相迅速分離。DNA提取過程有機相中主要是酚和蛋白結合，從而使得蛋白和DNA脫離，DNA進入水相。但是在RNA的提取過程就要避免蛋白和DNA脫離，否則DNA會釋放到水相。不管有酚也好，沒有酚也好，氯仿本身也對蛋白有變性作用，劇烈的震蕩，很容易使得DNA的親水基團，與水相接觸。所以不要劇烈震蕩。
異丙醇的作用是通過-OH的疏水作用使得RNA或者DNA鏈中的親水基團受到保護，等同於沈澱，但是這是個反應時發生在水相中，與前面的氯仿不矛盾。
細胞中還有許多種類和功能不壹的小型RNA，像是組成剪接體的snRNA，負責rRNA成型的snoRNA，以及參與RNAi作用的miRNA與siRNA等，可調節基因表達。而其他如I、II型內含子、RNaseP、HDV、核糖體RNA等等都有催化生化反應過程的活性，即具有酶的活性，這類RNA被稱為核酶。
在各種生物活動中，RNA起著至關重要的作用。脫氧核糖沒有2‘-OH.RNA的2‘-OH中的O（氧原子）可以在氫氧根（水）和氫結合的時候靠近3’碳原子下面的磷酸基團形成包含5個***價鍵的P（5個P-O）。
RNA和DNA屬於核酸，加上脂質、蛋白質和碳水化合物。核糖的2位碳上連有羥基為RNA的壹個重要結構特點。這類羥基使得RNA雙鏈的結構應與A型構象最接近，不過，在單鏈的某些二核苷酸環境下，也有極小的可能形成DNA最常見的B型螺旋構象。