東海：島嶼個數最多，約占全國海島總數的2/3（約4000多個），僅浙江沿海就有3000多個，而且分布比較集中。大島、群島也較多，並沿近海分布，如臺灣島、崇明島、海壇島、東山島、金門島、廈門島、玉環島、洞頭島和舟山群島、南日群島、澎湖列島等島群。
南海：島嶼數量居第二，約有1700多個，占我國海島總數的1/4左右。其中絕大部分靠近大陸，主要大島和群島有海南島、東海島、上川島、下川島、大濠島、香港島、海陵島、南澳島、潿洲島和萬山群島，只有屬於珊瑚島群的南海諸島遠離祖國大陸。
黃海：黃海島嶼較少，只有500多個，主要分布於黃海北部、中部的我國大陸壹側和渤海海峽，多為陸域面積在30平方公裏以下的小島，並主要以群島形式分布。
渤海：是我國海島數量最少的海域，只在沿岸有零星的分布，面積更小，主要有菊花島、石臼坨、桑島。分布格局上，在山地、丘陵海岸及河口附近較多，在平原海岸外很少有島嶼存在。