1、辦理保健食品經營許可證方法如下：
（1）到當地工商部門申請名稱預先核準通知書，也就是確定店名；
（2）到當地縣區級的食品藥品監督管理局申請保健品經營許可證；
（3）取得保健品經營許可證之後繼續在工商部門辦理個體工商戶營業執照需要的材料是：身份證原件和復印件，店鋪的房產證明文件房產證復印件或者土地證復印件等東西，租賃合同原件和復印件，證件相片壹張， 保健品經營許可證原件和復印件；
（4）取得營業執照30天內到當地的地稅、國稅部門申請稅務登記證。
2、法律依據：《保健食品管理辦法》第十四條
在生產保健食品前，食品生產企業必須向所在地的省級衛生行政部門提出申請，經省級衛生行政部門審查同意並在申請者的衛生許可證上加註“XX保健食品”的許可項目後方可進行生產。第十五條
申請生產保健食品時，必須提交下列資料：
（1）有直接管轄權的衛生行政部門發放的有效食品生產經營衛生許可證；
（2）《保健食品批準證書》正本或副本；
（3）生產企業制訂的保健食品企業標準、生產企業衛生規範及制訂說明；
（4）技術轉讓或合作生產的，慶提交與《保健食品批準證書》的持有者簽定的技術轉讓或合作生產的有效合同書；
（5）生產條件、生產技術人員、質量保證體系的情況介紹；
（6）三批產品的質量與衛生檢驗報告。
二、辦理預售許可證需要什麽材料
需要以下材料：
1、營業執照；
2、資質證書、開發合同、開發經營許可證；
3、土地使用權證或合法用地文件；
4、建設工程規劃許可證；
5、開工許可證；
6、單體工程審查表；
7、施工合同；
8、工程施工進度計劃。