1、時間不同：發芽和出苗的時間不同。發芽是種子開始萌發的過程，在種子埋入土壤後幾天內就可以看到發芽的跡象。而出苗是種子發芽後，幼苗從土壤中鉆出來露出地面的過程，時間比發芽晚幾天。
2、生理狀態不同：發芽和出苗的生理狀態不同。發芽是種子開始萌發並長出根和胚芽的過程，種子內部的營養開始被消耗，開始向外提供養分以支持幼苗的生長，而出苗則是幼苗通過根系吸收土壤中的養分和水分，逐漸長大的過程。