Rootkit數據最初是出於善意的目的，但後來Rootkit也被黑客用來入侵和攻擊他人的計算機系統，以及計算機病毒、間諜軟件等。經常使用rootkit來隱藏他們的蹤跡，因此Rootkit已被大多數防病毒軟件歸類為有害的惡意軟件。Linux、Windows、Mac OS等操作系統都有機會成為Rootkit的受害者。