壹、指代不同
1、原文件：有檔案原件，戶口原件、保密文件、商標原件、限制文件、法律原件和其他文件原件等。
2、源文件：是指未編譯的按照壹定的程序設計語言規範書寫的文本文件。
二、形式不同
1、原文件：區別於復制件的原始文件。主要指文件中，具有原始法律效益，特別指蓋章的文件。
2、源文件：可以是以書籍或者磁帶的形式出現，但最為常用的格式是文本文件，這種典型格式的目的是為了編譯出計算機程序。
三、目的不同
1、原文件：原件較復印件和其他轉存文件有更高的法律效應，政府機關各項事宜基本以原件為主。
2、源文件：將人類可讀的文本翻譯成為計算機可以執行的二進制指令，這種過程叫做編譯，通過編譯器完成。
百度百科-源文件
百度百科-原件