首先，妳所說的SQLServer應該是指SQLServer的管理工具SQL Server Management Studio（SSMS）吧。
前者是SQL SERVER自帶的管理工具，功能比較齊全，包括開發、性能管理、代理作業、數據庫管理、權限管理等等；而SQLNativeClient只是針對SQL SERVER的第三方工具，功能沒有SSMS多。
這兩個工具適合不同的人，管理員或者專業的開發人員適合用SSMS，而其他開發人員只是因為系統需要對數據進行操作，只是做壹些簡單的開發，那後者對於他們來說是比較方便、易用。
總結來說，兩者都是針對SQL SERVER的工具，看自己適合用哪個，或者用哪個更方便、快捷。