在壹個秘密軍事基地中，壹群科學家正在研究粒子技術，該技術壹旦得以應用，可以毫無聲息地分解任何物質，摧毀地球上的壹切。在壹次實驗中，太空漂浮物擊中了奧德賽衛星，導致黑暗物質泄漏。負責該項研究的科學家丹尼爾前往實驗室查看黑暗物質的核心，卻被黑暗物質感染。
丹尼爾並未將自己被感染的情況告訴其他人，他的身體在不知不覺中發生變化，他甚至擁有可以控制天氣的超能力。然而因黑暗物質的不斷侵襲，丹尼爾的身體也日趨虛弱。醫生出身的妻子愛莉對丹尼爾很是擔心，為他進行了全面檢查，卻並未發現異樣。因黑暗物質泄漏，導致該區域上空壹架偵察機失蹤，這項研究被迫暫停，軍方封閉了實驗室，所有人都被趕了出來。
粒子研究小組的負責人麥克雷將這項技術出售給了某壹國家，該國家派遣拉金博士前往談判。麥克雷派人潛入實驗室盜取核心，此刻恰好丹尼爾和助手安迪也來到實驗室試圖尋找黑暗物質泄漏的原因，他們目擊了麥克雷盜取核心的全過程，安迪甚至被對方用槍擊中了手臂。
丹尼爾向軍方克林頓將軍匯報了情況，大家並不知道麥克雷究竟想要幹什麽。克林頓將軍重新開放了實驗室，丹尼爾和其他科學家開始繼續研究阻止黑暗物質擴散的方法。與此同時，為了證實黑暗物質的能量，麥克雷在為拉金博士演示其威力，目標就是丹尼爾所在的實驗室。黑暗物質通過衛星向實驗室發射，瞬間天空被黑暗物質籠罩，實驗室搖搖欲墜，馬上就要被分解。關鍵時刻丹尼爾利用身體裏的黑暗物質與之抗衡，竟然保住了實驗室。安迪目睹了壹切，丹尼爾不得不將自己感染的實情告訴了他。此刻丹尼爾身體十分虛弱，安迪代他進行研究，終於找到摧毀黑暗物質的方法。
麥克雷的計劃落空，拉金博士開始對所謂的黑暗物質的能力產生質疑。事實上，麥克雷知道對黑暗物質產生幹擾的就是丹尼爾，因為讓丹尼爾感染也是麥克雷的計劃之壹，他想知道人類在感染黑暗物質後會產生什麽樣的變化。為此麥克雷劫持了愛莉，使得丹尼爾不得不按照他的要求來到了麥克雷的秘密實驗室。
根據衛星定位，安迪很快找到了丹尼爾的位置，於是上報克林頓將軍，軍方派遣部隊前往支援。丹尼爾和麥克雷在實驗室的地下相遇，麥克雷在知道丹尼爾感染黑暗物質沒有死後，便已下定決心要將黑暗物質釋放到自己體內。現在他成功了，似乎麥克雷想要成為這個世界的主宰。但此刻安迪也啟動了摧毀裝置，麥克雷和黑暗物質壹起分解，然後隨著導管被抽走。與此同時，丹尼爾體內的黑暗物質也消失殆盡，他終於恢復成壹個正常人。