2016年4月16日00時25分在日本九州島（北緯32.75度，東經130.80度）發生7.3級地震，震源深度10千米。 熊本縣又發生數次5級以上的余震。
中國之聲駐日本特約觀察員黃學清介紹，日本熊本在4月16日夜裏1點25分又發生了超過6級的地震，相當於1995年阪神大地震的程度。
據CNN報道，美國地質專家Victor Sardina分析，淩晨7.3強震威力較前晚“前震”大，推估有30倍，這麽壹震，必定對當地造成眾多損傷，後續災情恐比前晚首波地震影響嚴重。
日本氣象廳最初將14日晚在熊本縣發生的震度為7、震級為6.5的地震定為“本震”，然而之後又修改為16日淩晨發生的裏氏7.3級的地震為本震，14日的地震為“前震”等，也表現出對此次地震的迷茫。
前氣象廳地震預測情報課長、現為靜岡大學客座教授的吉田明夫指出：“這兩次地震的形成結構不同，並非是‘前震—本震’的關系，而是看作獨立的活動更好。”十四日晚的地震發生在日奈久斷層帶，十六日淩晨的地震是在布田川斷層帶，因此是相鄰兩地帶發生的連動。日本政府的地震調查委員會在17日，也得出同樣的結論。
在大分縣“火山地帶、中央構造線沿線等不穩固地區也誘發了地震”(吉田氏)。氣象廳把14日的地震命名為“熊本地震”，然而仍有可能對更廣範圍的地震全貌進行探討，更改結論。