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未發現具有臨床意義的基因組微重復

發現表明在可靠地將全基因組測序用於臨床之前,技術性挑戰仍然存在

芝加哥 – 據3月12日發表在《美國醫學會雜誌》上的壹則研究報告披露,在壹項有12名成年人參與的探索性研究中,應用全基因組測序(WGS)與不完整的遺傳性疾病基因的覆蓋、檢測具有最高潛在臨床影響的基因變異的低復驗性,以及臨床報告發現的不確定性有關,盡管在某些案例中,WGS會發現基因變異株從而引入早期的醫療幹預措施。

隨著進行人類DNA測序的技術性障礙的減少及其成本降至接近1000美元,全基因組測序(WGS)正日益被用於臨床醫學。測序可成功地協助臨床診斷並揭示罕見的家族性疾病的遺傳基礎。不管是何背景,即使是在看來健康的個體中,WGS預計也會揭示具有潛在臨床重要性的遺傳學發現。然而,根據文章的背景資訊,針對具有臨床意義的發現卻很少有綜合性的臨床解讀及報告。應用測序及與發現並報告這些及其它臨床發現有關的臨床機會和成本的技術靈敏度及臨床遺傳學發現的復驗性仍然還未被定義。

加州斯坦福的斯坦福遺傳性心血管疾病中心的Frederick E. Dewey, M.D.及其同事招募了12名成年誌願參與者,他們在2011年11月至2012年3月間進行了WGS。壹個多學科的團隊審查了所有潛在可報告的基因發現。五位醫師基於這些基因發現提出了最初的臨床追蹤。

研究人員發現,WGS的使用與不完整的遺傳性疾病基因的覆蓋有關;對發現具有最高潛在臨床影響的基因變異有著低復驗性;以及對臨床報告的WGS發現存在著不確定性。在每位參與者中發現了2-6個個人疾病風險的結果。醫師對測序結果的審查提示應考慮對每位參與者進行中位數(中點)為1-3個的初步診斷測試及轉診。

文章的作者寫道,他們對這壹技術的臨床經驗說明了在臨床上采用WGS的數個挑戰,其中包括盡管WGS的分析有效性正在得到改善,但對個體基因變異的敏感及準確評估的技術性挑戰仍然存在。此外,對WGS數據進行全面臨床解讀的人類資源需求仍然是相當巨大的,且對可能引起疾病的基因變異株進行分類還存在著很大的不確定性。

“在臨床醫學上確定WGS的作用時應該要考慮到這些問題。”

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